人类白细胞对内毒素和运动反应的性别特异性信号通路与基因表达变异

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-83578

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

近年来，运动对免疫系统的影响日益受到关注，但性别及月经周期中性激素波动对运动免疫应答的影响程度仍不明确。利用先前发表的微阵列数据集，我们研究了力竭性运动（半程马拉松；运动前及运动后[30分钟、3小时、24小时]，全血培养±LPS（1小时））诱导的mRNA变化，特别关注性别差异（黄体期女性与男性）。在LPS刺激的培养中，炎症相关通路、TLRs、胞质DNA感知及RIG-I样受体在性别间呈差异性激活。性别间差异调控的基因包括TNIP-1、TNIP-3、IL-6、HIVEP1、CXCL3、CCR3、IL-8和CD69，显示出女性相较于男性偏向于较少的抗炎基因调控。此外，若干与脑功能相关的基因（OLIG2、TMEM106B、DDIT4和KMO）在性别间表现出差异性激活。其中一些基因（如女性的KMO、两性的DDIT4）可能构成神经保护机制。

这些数据表明，运动诱导的基因表达变化可能依赖于性别和月经周期阶段。采用析因设计，比较男性和女性运动员在半程马拉松前后不同时间点（半程马拉松；运动前和运动后[30分钟、3小时、24小时]）经LPS处理和对照处理的血样。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。