类器官中自组织神经网络揭示前脑回路组装原理

主题标签:神经系统疾病、前脑回路组装、类器官、自组织神经网络、NWB、神经生理学、BRAIN Initiative。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2025-04-04 更新
浏览 18
其他神经系统疾病前脑回路组装类器官自组织神经网络NWB神经生理学BRAIN Initiative
Self-Organizing Neural Networks in Organoids Reveal Principles of Forebrain Circuit Assembly

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2025-04-04
版本
draft

资源简介

类器官中自组织神经网络揭示前脑回路组装原理

该数据集英文名为 Self-Organizing Neural Networks in Organoids Reveal Principles of Forebrain Circuit Assembly,来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 001374。它属于神经系统疾病 / 其他这一分类,是一项遵循 NWB 标准的神经生理学数据集,与 BRAIN Initiative 相关,联系人为 Blauvelt, Lon。从主题标签看,数据集围绕神经系统疾病、前脑回路组装、类器官、自组织神经网络、NWB、神经生理学以及 BRAIN Initiative 等关键词展开,面向神经系统疾病领域的公开数据共享。整体而言,该数据集以类器官中的自组织神经网络为切入点,关联前脑回路组装这一研究主题,并通过 NWB 标准组织神经生理学数据,为相关领域的研究者提供可访问的数据资源。

【数据集背景】

该数据集的主题背景涉及神经系统疾病与前脑回路组装。其英文名称直接指向“类器官中的自组织神经网络揭示前脑回路组装原理”,说明数据集关注的是类器官模型中神经网络如何自组织,以及这一过程与前脑回路组装原理之间的关系。同时,数据集被归入神经系统疾病 / 其他分类,并带有神经系统疾病这一主题标签,表明其应用语境与神经系统疾病研究领域相关。数据集与 BRAIN Initiative 存在关联,来源站为 dandiarchive.org,属于 DANDI Archive 中的 dandiset 001374。联系人信息为 Blauvelt, Lon。除上述内容外,源站未提供更详细的研究背景说明。

【数据内容】

该数据集是一项 NWB 标准的神经生理学数据集。其主题标签涵盖神经系统疾病、前脑回路组装、类器官、自组织神经网络、NWB、神经生理学以及 BRAIN Initiative。由此可知,数据集内容围绕类器官中的自组织神经网络展开,并以 NWB 标准进行组织,属于神经生理学数据范畴。数据集分类为神经系统疾病 / 其他,主题涵盖神经系统疾病。关于具体的记录模态、通道数量、采样率、实验条件、样本规模、时间跨度或具体指标等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001374。源站描述指出其为 NWB-standard neurophysiology dataset,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Blauvelt, Lon。除来源站、数据集编号、标准格式、所属计划及联系人之外,源站未提供关于采集设备、采集流程、实验方案、物种信息、伦理审批或具体采集地点的更多说明。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于神经系统疾病领域的研究,尤其是与前脑回路组装、类器官、自组织神经网络以及神经生理学相关的分析场景。由于其采用 NWB 标准,可用于需要标准化神经生理学数据格式的处理与分析流程。数据集与 BRAIN Initiative 相关,也可作为该计划框架下公开数据资源的一部分被使用。关于更具体的适用任务、推荐分析工具或典型研究问题,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为公开数据集,来源站为 dandiarchive.org,对应 dandiset 001374。使用者可通过该来源站访问该数据集。由于其为 NWB 标准的神经生理学数据集,使用时应遵循 NWB 标准数据的常规读取与处理方式。关于具体的下载步骤、访问权限、API 调用方式、配套代码或分析教程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 中的公开数据集,编号为 dandiset 001374,采用 NWB 标准,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Blauvelt, Lon。关于数据质量评估、完整性、噪声水平、批次效应、覆盖范围、已知偏差或使用限制等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集英文名称为 Self-Organizing Neural Networks in Organoids Reveal Principles of Forebrain Circuit Assembly,来源站为 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive dandiset 001374,联系人为 Blauvelt, Lon。关于具体的引用格式、DOI、许可条款或使用协议,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001374

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001374. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Blauvelt, Lon.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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