4DL 连接体分割：CFP 14.3.11-2R

数据集获取

源站：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/2748

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

神经系统连接组分析旨在发现并确立支撑正常与异常神经连接及功能的基本原则。在Hirst等人（2013）的研究中，我们通过对小鼠第四深部蚓状肌（4DL）运动单位连接的图像分析，利用运动神经元中荧光蛋白的转基因表达作为形态学报告基因。我们开发了一种方法，加速了4DL运动单位共聚焦图像投影的分割过程，其策略是在必要时才应用高分辨率（63×，1.4 NA物镜）成像或去卷积，以解决在较低光学分辨率（40×，1.3 NA）下成像时，因轴突交叉导致的轴突终末正确归属至已识别运动单位的不确定性。此数据集源自小鼠足垫肌肉14.3.11-2R中青色荧光蛋白（CFP）的表达。该压缩包包含三个子目录，分别包含原始图像及轴突分割和终板分析的数据。

与本研究相关的其余数据集中收录于爱丁堡大学数据共享平台的“小鼠第四深部蚓状肌连接组分析”数据共享集合中，网址为http://datashare.is.ed.ac.uk/handle/10283/2657。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。