光遗传学耳蜗刺激诱发中脑活动的原始数据与代码

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23244607

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 9.68 GB。

数据说明

光遗传学耳蜗刺激诱发中脑活动，具有接近生理性的时间保真度 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 可用于重建Koert等人手稿中所示图表的数据和代码。该数据集由德国哥廷根的听觉神经科学研究所的Elisabeth Koert整理。数据由Elisabeth Koert、Jonathan Goetz和Niels Albrecht记录。它还包括其他用户重新分析的数据，这些数据先前已按照手稿方法中所述发表。FEATHER工具箱由Anna Vavakou、Elisabeth Koert和Niels Albrecht开发。该项目由Bettina Wolf和Tobias Moser监督。Scripts文件夹包含分析数据和绘制图表所需的所有MATLAB脚本。其中有一个script00_main.m，引导完成所有单独步骤。使用MATLAB 2022b生成手稿图表。

要运行它，你需要一份FEATHER工具箱（https://github.com/elisabethkoert/FEATHER）和matnwb工具箱（https://github.com/NeurodataWithoutBorders/matnwb/releases）的副本，手稿中使用的版本也已在此提供。NWB__*文件夹包含了所有必要的数据（听觉脑干反应、下丘脑32通道电极记录和组织学结果），采用Neurodata Without Borders标准化格式（每只动物的数据与元数据各一个文件）。脚本中包含一个辅助工具，可使用此数据集初始化FEATHER工具箱格式中的所有对象。对于IC记录，此数据集仅包含提取的多单位峰时间，而不包含原始电压轨迹。gjg129771和gjg129773包含了两个IC记录的原始数据，这些数据对于展示单个原始轨迹的图表是必要的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。