phs000707:下一代孟德尔遗传学:遗传性神经系统疾病

数据围绕遗传性神经系统疾病,采用 Case Set 与 Family 设计,可用于研究孟德尔遗传模式下的神经系统疾病遗传基础(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case Set, Family
phs000707: Next Generation Mendelian Genetics: Hereditary Neurological Disorders

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000707:下一代孟德尔遗传学:遗传性神经系统疾病

phs000707: Next Generation Mendelian Genetics: Hereditary Neurological Disorders 是一个聚焦于遗传性神经系统疾病的公开研究数据集,收录于美国国家生物技术信息中心(NCBI)的 dbGaP 数据库。该数据集以病例集合(Case Set)与家系(Family)为核心设计,旨在支持对孟德尔遗传模式下神经系统疾病遗传基础的探索。其分类归属于神经系统疾病 / 其他,主题标签同样指向病例集合与家系。整体而言,该数据集为研究者提供了围绕遗传性神经系统疾病的家系与病例层面的数据资源,适用于从遗传学角度理解此类疾病的传递规律与致病机制。

【数据集背景】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究项目,英文全称为 phs000707: Next Generation Mendelian Genetics: Hereditary Neurological Disorders。dbGaP 作为基因型与表型关联研究的公共数据库,收录了该研究以病例集合和家系为设计框架的数据。研究主题聚焦于遗传性神经系统疾病,属于孟德尔遗传学范畴,即遵循经典单基因遗传模式的疾病研究。此类研究通常关注疾病在家系中的传递方式,以及特定基因变异与神经系统表型之间的关联。该数据集正是围绕这一方向构建,为后续遗传分析提供基础数据支撑。

【数据内容】

数据集的核心内容围绕遗传性神经系统疾病展开,采用病例集合与家系两种设计形式。病例集合意味着数据中包含受特定神经系统疾病影响的个体样本;家系设计则意味着数据涵盖多个家庭成员,能够反映疾病在家族内的传递关系。主题标签明确标注为 Case Set 与 Family,说明数据组织方式以病例和家系为单位。源站描述仅指出其为 dbGaP study (Case Set, Family),未进一步说明具体的样本数量、家系数量、基因分型平台、表型字段或变异位点信息。因此,关于数据内容的具体规模与细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,具体归属于 dbGaP 数据库。源站描述将其标识为 dbGaP study,并注明设计类型为 Case Set 与 Family。除来源站点与数据库归属外,关于样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批信息以及数据提交机构等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其病例集合与家系的设计,该数据集适用于研究孟德尔遗传模式下的神经系统疾病遗传基础。具体而言,可用于家系连锁分析、单基因遗传模式推断、候选基因或全基因组关联研究,以及遗传性神经系统疾病的致病变异识别等方向。由于数据围绕遗传性神经系统疾病构建,其适用场景集中于遗传学与神经病学的交叉领域,尤其是针对遵循孟德尔遗传规律的疾病研究。关于更细化的适用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台提供。dbGaP 通常要求研究者通过受控访问申请流程获取个体层级数据,具体申请步骤、访问权限级别以及数据下载方式需参照 dbGaP 官方指引。关于该数据集的具体使用方法、所需工具或分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述仅标明该研究为 dbGaP study,设计类型为 Case Set 与 Family,未提供样本质量评估、数据完整性、缺失率、基因分型质控指标或家系结构验证等信息。因此,关于数据质量的具体指标与局限性,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 数据库,标识为 phs000707。关于引用格式、许可条款、数据使用协议以及受控访问的具体要求,源站未提供。使用者应参照 dbGaP 官方页面获取引用与许可相关信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000707

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

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