雌性小鼠PVN光学标记催产素神经元记录

该数据集属于神经系统疾病领域,采用 NWB 标准格式组织神经生理学数据,来源于 BRAIN Initiative 相关项目

dandi
2025-06-19 更新
浏览 8
其他神经系统疾病催产素神经元PVN神经生理学NWBDANDI ArchiveBRAIN Initiative
Optically tagged oxytocin neuron recordings from female mouse PVN

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2025-06-19
版本
0.250620.1610

资源简介

雌性小鼠PVN光学标记催产素神经元记录

Optically tagged oxytocin neuron recordings from female mouse PVN 是一个公开的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001511。该数据集属于神经系统疾病领域,采用 NWB 标准格式组织神经生理学数据,来源于 BRAIN Initiative 相关项目。数据主题围绕雌性小鼠下丘脑室旁核(PVN)中经光学标记的催产素神经元记录展开,联系人为 Caslin, Asha。整体而言,该数据集为研究催产素神经元的电生理活动提供了标准化的公开数据资源,适用于神经科学基础研究与神经系统疾病相关探索。

【数据集背景】

该数据集属于神经系统疾病分类下的公开数据资源,主题涵盖神经系统疾病。其英文名称为 Optically tagged oxytocin neuron recordings from female mouse PVN,表明研究对象为雌性小鼠下丘脑室旁核(PVN)中经光学标记的催产素神经元。催产素神经元是下丘脑中的重要神经元类型,参与多种生理与行为过程。该数据集依托 BRAIN Initiative 背景,采用 NWB 标准神经生理学数据格式,旨在为相关研究提供可共享、可复用的记录数据。数据来源站为 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001511。

【数据内容】

该数据集的核心内容为光学标记的催产素神经元记录,记录对象为雌性小鼠的 PVN 区域。数据以 NWB 标准神经生理学数据格式组织。除上述信息外,源站未提供关于具体记录通道数、采样率、记录时长、动物数量、实验条件、刺激类型或行为范式等更详细的数据内容说明。

【采集与来源】

数据来源于 dandiarchive.org,即 DANDI Archive,数据集编号为 dandiset 001511。该数据集属于 BRAIN Initiative 相关项目,采用 NWB 标准。联系人为 Caslin, Asha。除来源站、编号、标准格式与联系人外,源站未提供关于采集设备、采集地点、实验时间、动物品系、年龄、性别以外的动物信息或具体采集流程的进一步说明。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病领域的神经生理学研究,尤其是与催产素神经元电生理活动相关的分析。由于数据采用 NWB 标准格式,可用于神经生理数据的标准化处理、跨数据集比较以及可重复性研究。其主题涵盖神经系统疾病,因此也可能服务于与催产素系统相关的疾病机制探索。除上述方向外,源站未提供关于具体适用场景、推荐分析流程或特定疾病模型的说明。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准神经生理学数据格式提供,可通过 DANDI Archive 获取,数据集编号为 dandiset 001511。使用者可依据 NWB 标准工具链读取和处理数据。除格式与来源信息外,源站未提供关于下载方式、访问权限、推荐软件、预处理步骤或分析代码的进一步说明。

【质量与限制】

该数据集为 BRAIN Initiative 相关项目下的 NWB 标准神经生理学数据,来源于 DANDI Archive。除上述信息外,源站未提供关于数据质量评估、缺失情况、噪声水平、验证结果或使用限制的具体说明。

【引用与许可】

该数据集的联系人为 Caslin, Asha,来源站为 dandiarchive.org,数据集编号为 dandiset 001511。除上述信息外,源站未提供关于引用格式、许可协议、使用条款或版权归属的具体说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001511

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001511. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Caslin, Asha.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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