NHP patch-seq 神经生理数据集

NHP patch-seq 是一个公开的神经科学数据集,归属于神经系统疾病这一大类,并在分类上被列入“其他”子项。根据源站描述,这是一个遵循 NWB 标准的神经生理学数据集,属于 BRAIN Initiative 相关成果,联系人为 Dong, Qiping

dandi
2025-06-16 更新
浏览 9
其他神经系统疾病神经生理NWBBRAIN InitiativeDANDI Archivepatch-seq
NHP patch-seq

基本信息

模态
其他
创建/更新时间
2025-06-16
版本
0.261006.2257

资源简介

NHP patch-seq 神经生理数据集

NHP patch-seq 是一个公开的神经科学数据集,归属于神经系统疾病这一大类,并在分类上被列入“其他”子项。该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 001475。根据源站描述,这是一个遵循 NWB 标准的神经生理学数据集,属于 BRAIN Initiative 相关成果,联系人为 Dong, Qiping。从整体定位来看,该数据集面向神经系统疾病领域的研究需求,主题涵盖神经系统疾病,旨在为相关科研人员提供可获取、可复用的数据资源,以支持神经生理学及疾病机制方面的探索。以下将从多个方面对该数据集作进一步介绍。

【数据集背景】

该数据集属于神经系统疾病领域,并被归入“其他”类别,说明其主题与神经系统疾病相关,但并未被进一步细分为某一特定疾病类型。数据集来源于 DANDI Archive,这是公开的神经科学数据归档平台,dandiset 编号为 001475。源站描述指出该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Dong, Qiping。除上述内容外,关于该数据集的具体研究背景、立项动机及所属项目细节,源站未提供。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集是一个 NWB 标准的神经生理学数据集。NWB 是一种常用于神经电生理数据存储与交换的标准格式,通常用于组织神经生理记录及相关元数据。数据集名称中包含“patch-seq”,提示其可能与膜片钳记录与测序相结合的技术方向有关,但源站描述中仅明确其为神经生理学数据集,未进一步说明具体包含哪些细胞类型、脑区、动物模型或记录模态。关于数据的具体内容组成、文件结构、样本数量及变量信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001475。源站描述标明其为 BRAIN Initiative 相关的 NWB 标准神经生理学数据集,联系人为 Dong, Qiping。关于数据采集的具体实验方法、采集设备、采集地点、采集时间以及实验对象等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集被归类于神经系统疾病领域,主题涵盖神经系统疾病,因此可面向神经系统疾病相关的神经生理学研究场景。由于其被描述为 NWB 标准的神经生理学数据集,理论上可用于神经生理数据的查看、分析或复用。但源站描述中未列出具体的适用分析任务、推荐研究问题或典型应用案例。关于该数据集的具体适用场景,源站未提供更多细节。

【使用方法】

该数据集托管于 DANDI Archive,dandiset 编号为 001475,可通过该平台获取。源站描述中未说明具体的数据下载方式、访问权限、所需工具或读取流程。关于如何使用该数据集,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述仅说明该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,未提供关于数据质量、完整性、噪声水平、批次效应或已知偏差的说明。关于该数据集的质量评估与使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 DANDI Archive,dandiset 编号为 001475,联系人为 Dong, Qiping。源站描述中未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款。关于引用方式与许可信息,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001475

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001475. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Dong, Qiping.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。