大鼠体感皮层光遗传与经颅聚焦超声刺激下的神经脉冲数据
主题标签：神经系统疾病、神经生理学、光遗传刺激、经颅聚焦超声、体感皮层、神经脉冲、NWB、BRAIN Initiative
基本信息
资源简介
大鼠体感皮层光遗传与经颅聚焦超声刺激下的神经脉冲数据
该数据集名为 Neural Spiking Data in Rats Responding to Optogenetic Stimulation and Transcranial Focused Ultrasound Stimulation in the Somatosensory Cortex，收录于 DANDI Archive，编号为 dandiset 000955。它属于神经生理学领域的 NWB 标准数据集，来自 BRAIN Initiative，联系人为 Ramachandran, Sandhya。数据集围绕大鼠体感皮层，在光遗传刺激与经颅聚焦超声刺激条件下记录神经脉冲活动，主题标签涵盖神经系统疾病、神经生理学、光遗传刺激、经颅聚焦超声、体感皮层、神经脉冲、NWB 与 BRAIN Initiative。本站将其归入神经系统疾病 / 其他分类，可为相关神经调控与神经编码研究提供原始电生理数据资源。
【数据集背景】
该数据集产生于 BRAIN Initiative 相关研究背景，聚焦于神经调控手段对大脑皮层神经元活动的影响。研究关注两种刺激方式：光遗传刺激与经颅聚焦超声刺激，并以大鼠体感皮层为作用与记录区域。光遗传刺激通常借助遗传学手段使特定神经元对光敏感，从而实现细胞类型或通路层面的精准激活；经颅聚焦超声刺激则是一种非侵入性的神经调控方式，可在不直接植入电极的情况下作用于深部或皮层区域。将两者结合在同一实验框架下，有助于比较不同调控方式引发的神经脉冲响应特征。数据集以 NWB 标准组织神经生理学数据，符合 BRAIN Initiative 推动数据共享与标准化的方向。联系人为 Ramachandran, Sandhya。
【数据内容】
数据集的核心内容为大鼠体感皮层在光遗传刺激与经颅聚焦超声刺激条件下的神经脉冲数据。主题标签明确指向神经脉冲，说明数据包含神经元放电事件层面的记录。数据以 NWB 标准格式组织，属于神经生理学数据集。涉及的主题领域包括神经系统疾病、神经生理学、光遗传刺激、经颅聚焦超声、体感皮层、神经脉冲、NWB 以及 BRAIN Initiative。除上述主题与记录类型外，源站未提供更细粒度的数据内容说明，例如具体神经元数量、记录时长、刺激参数、动物个体数量或分组设计等。
【采集与来源】
数据来源站为 dandiarchive.org，对应 DANDI Archive 的 dandiset 000955。源站描述指出该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集，属于 BRAIN Initiative，联系人为 Ramachandran, Sandhya。采集对象为大鼠，记录区域为体感皮层，实验条件涉及光遗传刺激与经颅聚焦超声刺激。关于具体的采集设备、电极类型、手术方法、刺激剂量与时间参数、伦理审批信息等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经生理学与神经调控相关的研究场景。由于同时涉及光遗传刺激与经颅聚焦超声刺激，并记录体感皮层的神经脉冲活动，可用于分析不同刺激方式下神经元放电模式的变化，也可用于方法学比较、神经编码分析或神经调控机制探索。其 NWB 标准格式便于与遵循同一标准的数据集进行整合分析。主题标签中包含神经系统疾病，提示该数据可能与神经系统疾病相关的神经调控研究存在关联。但源站未提供具体适用场景的说明，以上仅为基于主题标签与数据类型的通用用途描述。
【使用方法】
数据以 NWB 标准格式提供，可通过 DANDI Archive 获取，dandiset 编号为 000955。使用者可借助支持 NWB 格式的工具读取神经脉冲数据，并结合光遗传刺激与经颅聚焦超声刺激的实验条件进行分组分析。关于具体的下载方式、访问权限、推荐分析流程或配套代码，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 DANDI Archive，属于 BRAIN Initiative 相关数据，采用 NWB 标准，具备一定的标准化基础。联系人信息明确为 Ramachandran, Sandhya。但源站未提供关于数据质量、缺失情况、伪迹处理、样本量或验证结果的说明。使用者在解释结果时，应结合源站提供的原始描述与自身分析需求进行判断。除已提及的信息外，源站未提供其他质量与限制相关内容。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式与许可条款。使用者如需引用或使用，应前往 DANDI Archive 的 dandiset 000955 页面查阅官方说明，并联系 Ramachandran, Sandhya 获取进一步信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://dandiarchive.org/dandiset/000955
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DANDI Archive dandiset 000955. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Ramachandran, Sandhya.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
