人海马切片网络活动与光遗传干预的多模态评估

主题标签:神经系统疾病、海马切片、光遗传学、神经生理、NWB、BRAIN Initiative。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2026-03-30 更新
浏览 11
时间序列回归神经系统疾病海马切片光遗传学神经生理NWBBRAIN Initiative
Multimodal evaluation of network activity and optogenetic interventions in human hippocampal slices

基本信息

模态
时间序列
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-03-30
版本
0.241130.1903

资源简介

人海马切片网络活动与光遗传干预的多模态评估

该数据集英文名为 Multimodal evaluation of network activity and optogenetic interventions in human hippocampal slices,来源于 dandiarchive.org,属于 DANDI Archive 中的 dandiset 001132。其源站描述指出,这是一个遵循 NWB 标准的神经生理学数据集,隶属于 BRAIN Initiative,联系人为 Andrews, John P.。在分类上,该数据集归入神经系统疾病 / 其他。综合其主题标签来看,数据集围绕神经系统疾病、海马切片、光遗传学、神经生理、NWB 以及 BRAIN Initiative 等关键词展开,属于神经系统疾病领域的公开数据集。整体而言,该数据集面向人类海马切片中网络活动的多模态评估以及光遗传学干预研究,提供符合 NWB 标准的神经生理数据资源,可供相关领域的研究人员检索与使用。

【数据集背景】

该数据集的主题背景集中在神经系统疾病领域,同时涉及海马切片、光遗传学与神经生理等方向。海马切片是神经科学研究中常用的体外实验制备形式,可用于在受控条件下观察神经元网络活动;光遗传学干预则通过光学手段对特定神经成分进行调控,从而评估网络活动的变化。数据集名称中的“多模态评估”提示其关注多种测量或分析方式的结合,而“人类海马切片”则表明研究对象为人源组织切片。数据集被归入神经系统疾病 / 其他类别,说明其与神经系统疾病研究存在关联,但具体疾病类型、研究假设或临床指向,源站未提供。

【数据内容】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集。NWB 是一种面向神经科学数据的标准化格式,常用于组织电生理及其他神经生理相关记录,便于数据共享、复用与跨平台分析。数据集名称涉及网络活动与光遗传学干预的多模态评估,因此其内容主题与神经生理信号、网络活动评估以及光遗传学干预相关。除上述主题与格式信息外,关于具体记录通道数、采样率、受试者数量、切片数量、实验条件、干预参数、分析指标或数据文件规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,具体为 DANDI Archive 中的 dandiset 001132。DANDI Archive 是面向神经生理数据的公开归档平台,该数据集被标注为 BRAIN Initiative 相关数据。源站描述中列出的联系人为 Andrews, John P.。关于采集设备、采集地点、伦理审批信息、样本来源细节、实验时间范围以及具体采集流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与格式,该数据集适用于神经系统疾病领域的研究,尤其是围绕人类海马切片、网络活动评估以及光遗传学干预的神经生理分析。由于采用 NWB 标准,该数据集可用于支持标准化神经生理数据的读取、处理与再利用,也可作为方法学比较、多模态评估流程开发或光遗传学干预相关分析的参考数据资源。关于其是否适用于特定疾病建模、药物筛选、临床转化研究或教学用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准组织,通常可借助支持 NWB 格式的工具与软件进行读取、浏览和分析。使用者可通过 dandiarchive.org 上的 DANDI Archive 获取 dandiset 001132。关于具体的下载方式、访问权限、所需软件版本、分析示例、代码仓库或推荐处理流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被描述为 NWB 标准的神经生理学数据集,并属于 BRAIN Initiative 相关数据,这为其格式规范性与来源背景提供了基本说明。但关于数据质量评估、缺失情况、噪声水平、标注完整性、可重复性验证、样本量充分性以及使用中的技术限制,源站未提供。使用者应结合自身研究目的,对数据的适用性进行独立判断。

【引用与许可】

该数据集的联系人为 Andrews, John P.,来源站为 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive dandiset 001132。关于正式引用格式、作者列表、版本号、发布日期、许可证类型、使用条款或再分发要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001132

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001132. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Andrews, John P…

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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