巴西结节性硬化症家系TSC1和TSC2基因分子分析及表型关联

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2017 年 PLOS ONE 论文,聚焦巴西结节性硬化症家系中 TSC1 和 TSC2 基因的分子分析及表型关联

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2023-05-31 更新
浏览 2
基因组分类TSC 2 mutationstumor suppressor genetuberous sclerosisTSC 2 lociTSC 1 mutationstuberous sclerosis Tuberous sclerosisTSC 2TSC 1generation sequencing panelTSC 2 genes
Molecular analysis of TSC1 and TSC2 genes and phenotypic correlations in Brazilian families with tuberous sclerosis

基本信息

模态
基因组
大小
0.000192282 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

巴西结节性硬化症家系TSC1和TSC2基因分子分析及表型关联

Molecular analysis of TSC1 and TSC2 genes and phenotypic correlations in Brazilian families with tuberous sclerosis

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2017 年 PLOS ONE 论文,聚焦巴西结节性硬化症家系中 TSC1 和 TSC2 基因的分子分析及表型关联。研究对 53 例高度疑似结节性硬化症患者,采用 multiplex-ligation dependent probe amplification 与定制 next generation sequencing panel 检测两个基因,并用 Sanger 法确认变异,共鉴定 50 个不同变异。数据含 4 个文件(图与表格),可用于结节性硬化症致病突变谱、基因型-表型关联及巴西人群相关研究参考(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Molecular analysis of TSC1 and TSC2 genes and phenotypic correlations in Brazilian families with tuberous sclerosis》发表于 PLOS ONE(2017),DOI:10.1371/journal.pone.0185713。源站首次发布:2017-10-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):结节性硬化症复合体(TSC)是一种常染色体显性多系统疾病,特征为在许多器官和组织中发生多个错构瘤。它由两个基因 TSC1 和 TSC2 中任一基因的失活突变引起,在大多数错构瘤中遵循肿瘤抑制基因的二次打击机制。已在多个患者队列中对 TSC1 和 TSC2 位点的突变进行了全面筛查,并描述了广泛的致病突变谱。在巴西,尚无关于结节性硬化症发病率、患病率以及 TSC1 和 TSC2 突变的数据。我们使用 multiplex-ligation dependent probe amplification 和定制的 next generation sequencing panel 对 53 例高度疑似结节性硬化症患者的两个基因进行了分析。所有变异的确认均通过 Sanger 法完成。我们鉴定了 50 个不同的变异 i

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 192.28 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0185713。

【主题与分类】

源站学科分类:Microbiology、Cell Biology、Genetics、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:TSC 2 mutations、tumor suppressor gene、tuberous sclerosis、TSC 2 loci、TSC 1 mutations、tuberous sclerosis Tuberous sclerosis、TSC 2、TSC 1、generation sequencing panel、TSC 2 genes。本站分类:神经系统疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Microbiology、Cell Biology、Genetics、Ecology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Molecular_analysis_of_i_TSC1_i_and_i_TSC2_i_genes_and_phenotypic_correlations_in_Brazilian_families_with_tuberous_sclerosis/5460997

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Rosset, Clévia; Vairo, Filippo; Bandeira, Isabel Cristina; Correia, Rudinei Luis; de Goes, Fernanda Veiga; da Silva, Raquel Tavares Boy; et al. (2017). Molecular analysis of TSC1 and TSC2 genes and phenotypic correlations in Brazilian families with tuberous sclerosis. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "S1 Table.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/9452281"
curl -L -o "S2 Table.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/9452323"
curl -L -o "S3 Table.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/9452347"

文件清单

  • S1 Fig.pptx(137.34 KB)
  • S1 Table.docx(15.97 KB)
  • S2 Table.docx(21.42 KB)
  • S3 Table.docx(17.55 KB)

文件总体积 192.28 KB(源站 API 实测)。

数据说明

结节性硬化症(TSC)是一种常染色体显性遗传的多系统疾病,其特征是在许多器官和组织中发生多发性错构瘤。该病由TSC1和TSC2两个基因中任一基因的失活突变所致,大多数错构瘤中还存在肿瘤抑制基因的二次打击。已在多个患者队列中对TSC1和TSC2两个位点的突变进行了全面筛查,并描述了广泛的致病突变谱。在巴西,尚无关于结节性硬化症发病率、患病率以及TSC1和TSC2突变的数据。我们采用多重连接依赖探针扩增技术和定制的下一代测序panel,对53例高度怀疑结节性硬化症的患者进行了这两个基因的分析。所有变异均通过Sanger法进行确认。我们在47例(89%)患者中鉴定出50个不同的变异。其中5个为大片段重排,45个为点突变。我们这组患者所表现的症状在男性和女性个体之间无差异,唯一例外是女性中鲨鱼皮斑的发生更为常见(p = 0.028)。

在我们的系列研究中,与其他研究一致,TSC2突变与比TSC1突变更为严重的表型谱相关。这是首次旨在描述巴西结节性硬化症个体分子谱特征的研究。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0185713(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Molecular_analysis_of_i_TSC1_i_and_i_TSC2_i_genes_and_phenotypic_correlations_in_Brazilian_families_with_tuberous_sclerosis/5460997)。

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