多巴胺能与5-羟色胺能PSAP缺陷小鼠脑组织脂质与神经递质质谱成像数据
该数据集为MALDI-MSI（基质辅助激光解吸电离-质谱成像）实验数据，包含imzML格式文件，记录组织切片中x、y位置及m/z与强度信息
基本信息
资源简介
多巴胺能与5-羟色胺能PSAP缺陷小鼠脑组织脂质与神经递质质谱成像数据
Lipids and Neurotransmitters Mass Spectrometry Imaging Data from Dopaminergic PSAP Deficient (cPSAPDAT) and Serotonergic PSAP deficient (cPSAPSERT) Mice Brain Tissue sections
该数据集为MALDI-MSI（基质辅助激光解吸电离-质谱成像）实验数据，包含imzML格式文件，记录组织切片中x、y位置及m/z与强度信息。数据覆盖多巴胺能PSAP缺陷（cPSAPDAT）小鼠、5-羟色胺能PSAP缺陷（cPSAPSERT）小鼠以及6-OHDA诱导的帕金森病小鼠模型的脑组织切片，涉及脂质与神经递质的质谱成像。数据量足以重现手稿中的MSI部分，可用于研究Prosaposin（PSAP）调控鞘糖脂代谢与帕金森病的关系（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
项目资助方：Hjärnfonden (Swedish Brain Foundation) - FO2021-0318。源站首次发布：2025-02-17。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：上述文件为MALDI-MSI（基质辅助激光解吸电离-质谱成像）实验数据。该数据集包含imzML格式（MSI常用开放文件类型，包含组织中的x、y位置以及m/z和强度）以及更用户友好的格式。该数据集中的数据应足以重现手稿中的MSI部分。Prosaposin（PSAP）调节鞘糖脂代谢，可能与帕金森病（PD）相关。此处，脂质和神经递质的MALDI-MSI数据采集自多巴胺能PSAP缺陷（cPSAPDAT）小鼠和5-羟色胺能PSAP缺陷（cPSAPSERT）小鼠以及6-OHDA诱导的帕金森病小鼠模型。如有关于数据集的问题或需请求访问此处未上传的任何文件，请联系per.andren@uu.se
【数据结构与技术规格】
文件数 60 个，合计 40.91 GB。数据集 DOI：10.17044/scilifelab.23856609.v2。
【主题与分类】
源站学科分类：Biomedical imaging。主题标签：MALDI MSI technology、Parkinson's Disease、Lipids、Neurotransmitters。本站分类：神经系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biomedical imaging。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Lipids_and_Neurotransmitters_Mass_Spectrometry_Imaging_Data_from_Dopaminergic_PSAP_Deficient_cPSAP_sup_DAT_sup_and_Serotonergic_PSAP_deficient_cPSAP_sup_SERT_sup_Mice_Brain_Tissue_sections/23856609
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Kaya, Ibrahim; Nilsson, Anna; Shariatgorji, Reza; Andrén, Per (2023). Lipids and Neurotransmitters Mass Spectrometry Imaging Data from Dopaminergic PSAP Deficient (cPSAPDAT) and Serotonergic PSAP deficient (cPSAPSERT) Mice Brain Tissue sections. Uppsala University. Dataset
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据集大小约 40.91 GB。
数据说明
Ibrahim Kaya; Anna Nilsson; Reza Shariatgorji; Per Andrén (2025). Lipids and Neurotransmitters Mass Spectrometry Imaging Data from Dopaminergic PSAP Deficient (cPSAPDAT) and Serotonergic PSAP deficient (cPSAPSERT) Mice Brain Tissue sections [Dataset]. http://doi.org/10.17044/scilifelab.23856609.v2
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
