LINCS 数据门户

该计划设有六个数据与特征生成中心:药物毒性特征生成中心、HMS LINCS 中心、LINCS 转录组学中心、LINCS 信号与表观遗传学蛋白质组学表征中心、MEP LINCS 中心和 NeuroLINCS 中心

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时间序列神经系统疾病LINCS 数据转录组学蛋白质组学药物毒性表观遗传学信号传导
LINCS Data Portal

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

LINCS 数据门户

LINCS Data Portal 是一个提供 LINCS 数据访问的在线数据门户,汇集来自多个来源的 LINCS 数据。该计划设有六个数据与特征生成中心,分别为药物毒性特征生成中心、HMS LINCS 中心、LINCS 转录组学中心、LINCS 信号与表观遗传学蛋白质组学表征中心、MEP LINCS 中心和 NeuroLINCS 中心。本站将其归类于神经系统疾病 / 其他类别,源站为 lincsportal.ccs.miami.edu。该门户面向需要获取 LINCS 项目相关数据的研究人员,提供统一的数据访问入口,便于围绕上述六个中心所产生的数据开展检索与利用。

【数据集背景】

LINCS Data Portal 由 lincsportal.ccs.miami.edu 提供,其定位是让用户访问来自各种来源的 LINCS 数据。LINCS 计划设有六个数据与特征生成中心,分别是药物毒性特征生成中心、HMS LINCS 中心、LINCS 转录组学中心、LINCS 信号与表观遗传学蛋白质组学表征中心、MEP LINCS 中心和 NeuroLINCS 中心。这些中心构成了该计划数据与特征生成的主要组织框架,门户则作为这些数据对外提供访问的渠道。在本站分类体系中,该数据集归入神经系统疾病 / 其他类别。

【数据内容】

该门户提供对 LINCS 数据的访问,这些数据来自多个来源。数据与特征生成工作由六个中心承担:药物毒性特征生成中心、HMS LINCS 中心、LINCS 转录组学中心、LINCS 信号与表观遗传学蛋白质组学表征中心、MEP LINCS 中心和 NeuroLINCS 中心。关于各中心所生成数据的具体类型、字段结构、数据规模与文件格式,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源为 LINCS 计划下设的六个数据与特征生成中心,即药物毒性特征生成中心、HMS LINCS 中心、LINCS 转录组学中心、LINCS 信号与表观遗传学蛋白质组学表征中心、MEP LINCS 中心和 NeuroLINCS 中心。门户汇集来自各种来源的 LINCS 数据并提供访问。关于各中心数据的采集流程、实验方法、样本处理与更新机制,源站未提供。

【适用场景】

该门户适用于需要获取 LINCS 计划相关数据的访问与利用场景,用户可通过门户访问来自六个数据与特征生成中心及各种来源的 LINCS 数据。结合本站将其归入神经系统疾病 / 其他类别,可供关注该领域数据资源的研究人员作为数据获取入口。关于具体应用案例、分析任务与验证场景,源站未提供。

【使用方法】

用户通过源站 lincsportal.ccs.miami.edu 访问 LINCS Data Portal,以获取来自各种来源的 LINCS 数据。关于检索方式、浏览界面、下载流程、API 接口及账号要求等具体操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该门户的数据来自六个数据与特征生成中心及各种来源,其组织方式以中心为框架。关于数据质量控制标准、完整性、准确性评估、版本更新频率以及使用中的已知限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://lincsportal.ccs.miami.edu/dcic-portal

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LINCS数据门户提供了来自各种来源的LINCS数据的访问途径。该项目包含六个数据与特征生成中心:药物毒性特征生成中心、HMS LINCS中心、LINCS转录组学中心、LINCS信号传导与表观遗传学蛋白质组表征中心、MEP LINCS中心以及NeuroLINCS中心。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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