SHIELD植入期间大规模Neuropixels记录:动态门控参与度的视觉变化检测任务

从主题上看,该数据集围绕 SHIELD 植入条件下的神经活动记录展开,并涉及视觉变化检测任务中参与状态的动态门控。整体而言,它面向神经系统疾病及相关神经机制研究,提供公开可获取的标准化神经生理数据资源,便于研究者了解 SHIELD 植入与大规模 Neuropixels 记录在特定认知任务中的应用背景

dandi
2024-06-06 更新
浏览 8
其他分类NeuropixelsSHIELD植入视觉变化检测动态门控神经生理学NWB标准BRAIN Initiative
Large-scale Neuropixels recordings through SHIELD implant during visual change detection task with dynamic gating of engagement

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2024-06-06
版本
0.260922.1827

资源简介

SHIELD植入期间大规模Neuropixels记录:动态门控参与度的视觉变化检测任务

该数据集英文名为 Large-scale Neuropixels recordings through SHIELD implant during visual change detection task with dynamic gating of engagement,收录于 dandiarchive.org,属于神经系统疾病 / 其他分类。源站描述其为 DANDI Archive 的 dandiset 001051,是一套符合 NWB 标准的神经生理学数据集,属于 BRAIN Initiative 相关数据,联系人为 Bennett, Corbett。从主题上看,该数据集围绕 SHIELD 植入条件下的神经活动记录展开,并涉及视觉变化检测任务中参与状态的动态门控。整体而言,它面向神经系统疾病及相关神经机制研究,提供公开可获取的标准化神经生理数据资源,便于研究者了解 SHIELD 植入与大规模 Neuropixels 记录在特定认知任务中的应用背景。

【数据集背景】

该数据集来自 DANDI Archive,编号为 dandiset 001051,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源。其英文名称表明,数据采集与 SHIELD 植入条件下的 Neuropixels 记录有关,并涉及视觉变化检测任务以及参与状态的动态门控。本站将其归类为神经系统疾病 / 其他,说明其主题与神经系统疾病领域存在关联。源站描述仅提供了上述基本信息,未进一步说明研究机构、项目背景或科学假设。

【数据内容】

源站描述指出,该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集。其名称中包含“Large-scale Neuropixels recordings”,表明数据涉及大规模 Neuropixels 记录;“through SHIELD implant”表明记录通过 SHIELD 植入方式实现;“visual change detection task with dynamic gating of engagement”表明数据与视觉变化检测任务以及参与状态的动态门控有关。除这些信息外,源站未提供关于具体通道数、记录脑区、受试者数量、任务试次、行为指标或数据文件结构的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,源站描述为 DANDI Archive dandiset 001051,并注明联系人为 Bennett, Corbett。其被描述为 NWB 标准的神经生理学数据集,且属于 BRAIN Initiative 相关数据。关于采集设备的具体参数、植入手术细节、记录时长、实验地点、伦理审批信息以及数据生成的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可被用于与神经系统疾病领域相关的神经生理学研究,尤其是涉及 SHIELD 植入、大规模 Neuropixels 记录、视觉变化检测任务以及参与状态动态门控的研究场景。由于其为 NWB 标准数据集,也可能适用于需要标准化神经生理数据格式的分析流程。但源站未提供具体的适用任务、推荐分析目标或已验证的应用案例。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件组织方式、读取工具、预处理步骤或分析示例。该数据集以 NWB 标准形式存在,通常此类数据可借助支持 NWB 的工具进行读取,但源站未就此给出具体指引。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、噪声水平、缺失情况或已知限制的说明。由于缺乏具体指标与验证信息,无法进一步评估其质量特征或使用限制。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、许可条款或使用条件的具体信息。联系人为 Bennett, Corbett,但源站未说明数据共享许可类型或是否需要额外授权。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001051

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001051. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Bennett, Corbett.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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