刚性化颈动脉与未刚性化颈动脉小鼠脑内源光学成像与GCaMP数据
主题标签:神经系统疾病、内源光学成像、GCaMP、小鼠脑数据、颈动脉刚性化、NWB、神经生理。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

基本信息
资源简介
刚性化颈动脉与未刚性化颈动脉小鼠脑内源光学成像与GCaMP数据
该数据集英文名为 Intrinsic optical imaging (IOI) and GCaMP mouse brain data, with and without rigidified carotid artery,来自 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 001210。它属于神经系统疾病 / 其他这一分类,是一项以 NWB 标准组织的神经生理学数据集,与 BRAIN Initiative 相关,联系人为 Bakker, Marleen。数据集围绕内源光学成像、GCaMP、小鼠脑数据以及颈动脉刚性化等主题展开,面向神经系统疾病领域的公开数据共享。整体来看,该数据集将内源光学成像与 GCaMP 信号记录结合,并设置有无颈动脉刚性化条件的小鼠脑数据,为神经生理研究提供标准化、可获取的数据资源。
【数据集背景】
该数据集所属领域为神经系统疾病,同时被归入“其他”类别。其主题标签包括神经系统疾病、内源光学成像、GCaMP、小鼠脑数据、颈动脉刚性化、NWB 和神经生理。数据集来自 dandiarchive.org,具体为 DANDI Archive dandiset 001210。源站将其描述为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Bakker, Marleen。以上信息表明,该数据集是在神经系统疾病研究背景下,围绕小鼠脑成像与神经生理记录建立的公开数据资源。
【数据内容】
数据集英文名称明确包含 Intrinsic optical imaging (IOI) 与 GCaMP mouse brain data,并注明 with and without rigidified carotid artery。由此可知,数据内容涉及内源光学成像和 GCaMP 相关的小鼠脑数据,且包含颈动脉刚性化与未进行颈动脉刚性化两种条件。数据以 NWB 标准组织,属于神经生理学数据集。除上述内容外,源站未提供更细粒度的数据内容说明。
【采集与来源】
数据来源站为 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive dandiset 001210。源站描述其为 NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative),联系人为 Bakker, Marleen。关于采集设备、采集参数、实验动物数量、具体实验流程、时间跨度等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集面向神经系统疾病领域,主题涵盖内源光学成像、GCaMP、小鼠脑数据、颈动脉刚性化、NWB 与神经生理。作为公开数据集,它可用于与上述主题相关的研究场景,例如神经生理数据的标准化读取、内源光学成像与 GCaMP 数据的分析,以及涉及颈动脉刚性化条件的小鼠脑数据比较研究。除这些由主题标签和源站描述直接支持的方向外,源站未提供更具体的适用场景说明。
【使用方法】
该数据集以 NWB 标准组织,属于神经生理学数据集,并发布于 DANDI Archive。使用者可通过 dandiarchive.org 获取该数据集,具体下载方式、访问协议、数据组织结构和配套工具等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集被源站描述为 NWB-standard neurophysiology dataset,并关联 BRAIN Initiative,说明其采用 NWB 标准进行组织。关于数据质量、样本量、噪声水平、缺失情况、适用范围限制等,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive dandiset 001210,联系人为 Bakker, Marleen。关于引用格式、许可条款、使用限制和授权要求等,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001210
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DANDI Archive dandiset 001210. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Bakker, Marleen.
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




