基于配对树突棘钙成像与大规模胞外锋电位记录的单突触连接推断
它是一个遵循 NWB 标准的神经生理学数据集，并与 BRAIN Initiative 相关。数据集联系人列为 Xue, Xiaohan
基本信息
资源简介
基于配对树突棘钙成像与大规模胞外锋电位记录的单突触连接推断
该数据集英文名称为 Inferring monosynaptic connections from paired spine calcium imaging and large-scale recording of extracellular spiking，来源于 dandiarchive.org，对应 DANDI Archive 的 dandiset 000223。它是一个遵循 NWB 标准的神经生理学数据集，并与 BRAIN Initiative 相关。数据集联系人列为 Xue, Xiaohan。按其名称所述，该数据集围绕配对获取的树突棘钙成像与大规模细胞外脉冲记录，服务于单突触连接的推断研究。在分类上，它被归入神经系统疾病 / 其他。
【数据集背景】
神经科学中，理解神经元之间的连接关系是解析神经回路功能的重要基础。单突触连接推断通常需要将高空间分辨率的树突棘钙成像信息与能够覆盖大量神经元的细胞外脉冲记录信息结合起来。DANDI Archive 作为数据发布与共享平台，承载了 dandiset 000223 这一数据集。NWB 标准用于组织神经生理学数据，BRAIN Initiative 则与神经科学数据资源建设相关。关于该数据集的具体研究背景、所属项目、实验假设和科学目标，源站未提供。
【数据内容】
从数据集名称可知，其内容涉及两类配对的神经生理学记录：树突棘钙成像，以及大规模细胞外脉冲记录。数据集被描述为 NWB 标准的神经生理学数据集。除此之外，源站未提供关于数据文件结构、具体模态数量、记录通道数、成像视野、细胞或棘的数量、动物数量、脑区、实验条件、刺激类型、时间跨度等细节。因此，无法进一步说明其数据内容的具体组成。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 dandiarchive.org，标识为 DANDI Archive dandiset 000223。源站将其描述为 NWB 标准的神经生理学数据集，并提及 BRAIN Initiative。联系人信息为 Xue, Xiaohan。关于采集物种、样本来源、实验设备、成像与电生理采集参数、实验室、采集地点、采集时间以及数据提交者等更详细来源信息，源站未提供。
【适用场景】
就数据名称所指向的方向而言，该数据集可用于与单突触连接推断相关的研究场景，也可作为树突棘钙成像与大规模细胞外脉冲记录配对分析的神经生理学数据资源。DANDI Archive 上的 NWB 标准数据通常服务于数据共享、方法比较和再分析等通用用途。该数据集具体适合哪些分析任务、能否用于特定疾病模型或特定脑区研究，源站未提供。
【使用方法】
该数据集位于 DANDI Archive，编号为 dandiset 000223，采用 NWB 标准组织神经生理学数据。使用时可考虑通过 DANDI Archive 平台获取数据，并依据 NWB 生态的通用方式读取。关于具体下载地址、访问权限、所需软件版本、读取示例、预处理流程和分析代码，源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估指标、数据完整性说明、预处理程度、信噪比、伪迹处理、缺失数据情况、已知偏差或使用限制。由于这些信息缺失，无法对该数据集的质量水平和适用范围作出具体判断。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、版本信息、DOI、作者列表、许可协议和使用条款，源站未提供。已知来源为 dandiarchive.org，对应 DANDI Archive dandiset 000223，联系人列为 Xue, Xiaohan。若需引用或使用，应进一步查阅源站页面以确认正式引用格式和许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://dandiarchive.org/dandiset/000223
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DANDI Archive dandiset 000223。NWB 标准的神经生理学数据集（BRAIN Initiative）。联系人：Xue, Xiaohan。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
