先天性巨细胞病毒感染严重程度羊水预后生物标志物鉴定

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD029105

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

背景：先天性巨细胞病毒（cCMV）感染是一种常见的宫内感染，可导致神经发育障碍。对cCMV严重程度进行早期预后评估一直是一项持续存在的挑战。本研究旨在识别与cCMV相关胎儿脑损伤严重程度相关的羊水生物标志物。方法：对妊娠中期羊水样本进行全局蛋白质组分析，比较重度cCMV胎儿与无症状CMV感染胎儿（发现队列）。通过特异性免疫测定进一步测定所选差异分泌蛋白的水平，并在独立验证队列中进行评估，该队列包括来自不同中心的CMV感染胎儿的临床盲法羊水样本。结果：蛋白质组分析鉴定出29种羊水蛋白，其在重度cCMV胎儿与无症状cCMV胎儿之间丰度存在明显差异。

对差异分泌蛋白的通路分析揭示了炎症反应、细胞损伤、免疫性疾病、机体损伤和神经系统疾病等富集通路，凸显了母胎界面过度炎症与cCMV相关胎儿脑损伤发生之间的关联。重要的是，其中两种选定用于验证的蛋白——chemerin和半乳糖凝集素-3结合蛋白（Gal-3BP）——在区分17例重度cCMV胎儿与26例无症状CMV感染胎儿时，各自显示出88.2%的敏感性、100-96.2%的特异性、100-93.8%的阳性预测值和92.9-92.6%的阴性预测值，曲线下面积分别为0.98（chemerin）和0.97（Gal-3BP）。解读：这些结果确定了免疫调节蛋白chemerin和Gal-3BP作为cCMV严重程度的新型高预测性羊水生物标志物，可指导cCMV感染胎儿的早期预后分层和潜在的个体化治疗。资助：以色列科学基金会；Hadassah研究基金

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。