HaD-PET:DMT与harmine对脑葡萄糖代谢影响的FDG-PET数据集

该数据集来自openneuro.org,包含一项单盲、安慰剂对照、随机交叉研究中采集的神经影像数据,研究N,N-二甲基色胺(DMT)联合harmine的口腔黏膜制剂对健康志愿者脑葡萄糖代谢的急性影响

openneuro
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医学影像回归petmri
HaD-PET: Effects of DMT and harmine on cerebral glucose metabolism: FDG-PET dataset

基本信息

模态
医学影像
大小
14.118367214 GB
任务类型
回归
许可
CC0
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

HaD-PET:DMT与harmine对脑葡萄糖代谢影响的FDG-PET数据集

HaD-PET 数据集(全称:Effects of DMT and harmine on cerebral glucose metabolism: FDG-PET dataset)来源于开放神经影像平台 openneuro.org,收录了一项针对健康志愿者的神经影像学研究数据。该研究采用单盲、安慰剂对照、随机交叉设计,考察 N,N-二甲基色胺(DMT)联合 harmine 的口腔黏膜制剂对脑葡萄糖代谢的急性影响。数据集共包含 14 名被试,涵盖 PET 与 MRI 两种模态,并按照 BIDS 标准组织,提供原始影像、部分衍生数据、被试级元数据以及处理脚本与命令记录。数据集由 Klemens Egger、Milan Scheidegger、Paul Cumming 等作者发布,采用 CC0 许可,DOI 为 doi:10.18112/openneuro.ds007768.v1.0.0,发布时间为 2026 年 5 月 8 日。

【数据集背景】

该数据集围绕 DMT 与 harmine 联合给药对大脑葡萄糖代谢的急性效应展开。DMT 是一种具有致幻作用的色胺类物质,harmine 则常被用于调节其代谢与作用时长。研究采用口腔黏膜给药途径,并以单盲、安慰剂对照、随机交叉的方式在健康志愿者中开展,旨在观察给药后脑葡萄糖代谢的变化。数据集所属分类为神经系统疾病 / 其他,主题标签为 pet 与 mri,反映了其以正电子发射断层扫描和磁共振成像为核心的数据构成。

【数据内容】

数据集包含原始及部分选定的衍生神经影像数据,具体包括:T1 加权结构 MRI 扫描;每位参与者在两个研究阶段中采集的动态脑 [18F]FDG-PET 扫描;参与者级别的元数据文件 participants.tsv;derivatives/ 目录下的部分预处理与建模衍生数据;以及 code/ 目录下的处理脚本与命令记录。整体数据按照 BIDS 规范进行组织,便于标准化读取与复用。数据集模态覆盖 pet 与 mri,被试数为 14。

【采集与来源】

数据来自一项单盲、安慰剂对照、随机交叉研究。十四名健康男性参与者完成了两个影像采集阶段,采用被试内交叉设计。每个研究阶段均包含动态脑 [18F]FDG-PET 扫描,并配有 T1 加权结构 MRI 扫描。源站描述中关于每个阶段的具体流程在提供的信息中未完整呈现,相关细节源站未提供。数据集发布于 openneuro.org,作者为 Klemens Egger、Milan Scheidegger、Paul Cumming,发布时间为 2026 年 5 月 8 日。

【适用场景】

该数据集适用于研究 DMT 联合 harmine 急性给药对脑葡萄糖代谢影响的神经影像分析,尤其适合基于 [18F]FDG-PET 的动态脑代谢建模、结构 MRI 与 PET 的配准与联合分析,以及安慰剂对照交叉设计下的被试内效应评估。由于数据按 BIDS 组织并提供处理脚本与命令记录,也可用于方法学复现、预处理流程比较及衍生指标验证等场景。主题标签 pet 与 mri 表明其可服务于多模态神经影像研究。

【使用方法】

使用者可依据 BIDS 结构读取 T1 加权结构 MRI 与动态 [18F]FDG-PET 数据,结合 participants.tsv 中的参与者级别元数据开展分组或交叉条件分析。derivatives/ 目录提供了部分预处理与建模衍生结果,可作为分析起点或参考;code/ 目录中的处理脚本与命令记录有助于理解数据生成与处理流程。由于涉及动态 PET 与结构 MRI 的多模态数据,通常需要具备相应的神经影像处理工具与 PET 动力学建模知识。具体软件与参数设置源站未提供。

【质量与限制】

数据集来自单盲、安慰剂对照、随机交叉研究,被试数为 14,且参与者均为健康男性,样本量与性别构成可能限制结论的外推范围。数据包含原始与部分衍生结果,但衍生数据为“选定的”部分,并非全部分析产物。关于扫描参数、图像质量指标、缺失数据情况以及预处理细节,源站未提供。使用时应结合研究设计特点谨慎解释结果。

【引用与许可】

该数据集采用 CC0 许可,DOI 为 doi:10.18112/openneuro.ds007768.v1.0.0。引用时应注明数据集英文名 HaD-PET: Effects of DMT and harmine on cerebral glucose metabolism: FDG-PET dataset,作者 Klemens Egger、Milan Scheidegger、Paul Cumming,来源站 openneuro.org,发布时间 2026 年 5 月 8 日。

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使用方式

数据集获取

源站:https://openneuro.org/datasets/ds007768

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 14.12 GB。

数据说明

OpenNeuro dataset ds007768. Modalities: pet, mri. DX status: Healthy / Control. BIDS-standardized neuroimaging dataset (MRI/EEG/MEG/PET).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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