VCP相关ALS人干细胞模型中运动神经元病理与星形胶质细胞作用 [终末分化iPSC来源星形胶质细胞]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE99843

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

运动神经元（MNs）和星形胶质细胞（ACs）与肌萎缩侧索硬化（ALS）的发病机制有关，但它们之间的相互作用以及导致MN死亡的分子事件序列仍未明确。在此，我们优化了将诱导多能干细胞（iPSCs）定向分化为高度富集（>85%）的脊髓MNs和ACs功能性群体的方法。我们发现，在患者特异性的含缬酪肽蛋白（VCP）突变MNs中，细胞质TDP-43显著增加和内质网应激是主要的致病事件，继发线粒体功能障碍和氧化应激。累积而言，这些细胞应激导致VCP突变MNs的突触病理和细胞死亡。我们还发现了VCP突变ACs的细胞自主性存活表型，这不能归因于VCP突变MNs中发生的相同分子病理。最后，通过迭代共培养实验，我们揭示了VCP突变ACs对对照和突变MNs的非细胞自主性效应。这项工作阐明了可能指导未来ALS治疗策略的分子事件和细胞间相互作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。