胰岛细胞CD40L与对照基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE8873

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

CD40在非造血细胞中的表达与炎症相关。我们提供的证据表明，CD40——一种T细胞共刺激分子——在人β细胞中表达，且胰岛素瘤细胞中CD40的参与激活了NFKB和ERK1/2通路。人胰岛细胞中CD40的激活诱导了IL-8、MCP-1和MIP-1β的分泌，而NFkB和ERK1/2抑制剂可阻断这一过程。在本研究中，我们研究了胰岛细胞中由CD40-CD40L相互作用介导的基因表达。该方法鉴定出90个基因和转录本，在经可溶性CD40L处理后其表达强度至少增加1.7倍。相当数量的基因与炎症和氧化应激相关。我们发现CXCL1（Groα）、CXCL2（Mif2）和CXCL3强烈过表达；这些属于CXC家族的趋化因子在结构上与IL-8相关。从该组中选取11个基因，包括CXCL1，通过实时PCR进一步定量。用CD40L激活胰岛细胞以NFKB依赖的方式诱导了CXCL1的分泌。

在胰岛细胞中，CD40的参与并未诱导凋亡，也未引起β细胞死亡，并且未如胰岛素瘤细胞中所观察到的那样增强TNF-α介导的细胞死亡。在胰岛素瘤细胞中，CD40的激活导致突触蛋白I的ERK1/2依赖性磷酸化，该蛋白与神经元和β细胞中的胞吐机制相关。然而，用可溶性CD40L处理胰岛并未影响葡萄糖诱导的胰岛素分泌。已有报道称，人胰岛制备物中始终存在的导管细胞组成性表达CD40（参考文献）。我们发现，导管细胞中的CD40-CD40L相互作用与β细胞不同，可诱导致糖尿病细胞因子IFNγ和TNF-α的分泌。此外，将含有导管细胞的胰岛与CD40L共孵育，通过测量线粒体膜电位评估，降低了β细胞的活力。

关键词：胰腺，朗格汉斯岛，趋化因子，细胞因子，炎症

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。