酒精中毒内表型相关miRNA的全基因组鉴定

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE85389

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对乙醇的先天敏感性可能是理解酒精使用障碍的重要第一步。我们研究了与乙醇催眠效应倾向相关的大脑中被miRNA调控的转录表达，该倾向通过翻正反射丧失（LORR）来衡量。我们独立分析了来自LXS重组近交系小鼠大脑中miRNA和mRNA的表达与LORR的关联。随后，通过meta分析整合了这些结果，针对在miRNA靶标相互作用数据库中鉴定出的miRNA-mRNA靶标对。我们发现112个显著的miRNA-mRNA配对，其中绝大多数miRNA和mRNA高度相互关联。大多数配对显示了一种模式，即miRNA水平升高和mRNA水平降低与更敏感的酒精品系相关。例如，CaMKIIn1受到多个与LORR相关的miRNA的靶向作用。CAMK2N1是CAMK2的抑制剂，CAMK2除其他功能外，还能磷酸化或结合GABAA和NMDA受体。

我们的结果提示，miRNA对CAMK2抑制剂的调控及其下游靶点（包括GABAA和NMDA受体）具有新的作用，这些靶点此前已被认为与乙醇诱导的镇静和敏感性有关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。