多发性骨髓瘤神经病变全基因组关联研究数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66903

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在多发性骨髓瘤中开展全基因组关联研究，探讨其与毒性神经病变发生的关系。该数据集被用作验证集。我们使用Affymetrix HD-SNP 6.0芯片进行了一项全基因组关联研究，以识别在接受硼替佐米-地塞米松治疗后、于自体干细胞移植前接受治疗的469例多发性骨髓瘤（MM）患者中发生硼替佐米诱导的周围神经病变（BiPN）的风险变异，并在一个独立的116例MM患者队列中进行了验证。我们鉴定出一个此前未报道的BiPN风险位点，位于21q22.3（rs2839629，PKNOX1；OR = 0.53，95% CI：[0.40-0.69]）。已知PKNOX1可调控MCP-1，而MCP-1是化疗诱导的周围神经病变的一种强效介质。rs2839629与rs915854处于强连锁不平衡（r2 = 0.87），后者定位于CBS着丝粒侧6.5kb处，CBS编码内源性H2S生成酶。CBS-H2S信号通路与多种神经退行性和炎症性疾病的发病机制相关，尤其是在神经病变模型中。我们的数据为MM中BiPN的遗传易感性提供了确凿证据，并为神经保护治疗策略提供了新的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。