ALS患者人成纤维细胞与诱导多能干细胞的基因表达数据
该数据集来自 NCBI GEO（GSE64583），收录肌萎缩侧索硬化（ALS）患者来源的人成纤维细胞及经 Sendai 病毒介导重编程获得的诱导多能干细胞（hiPSc）的基因表达谱数据，采用芯片表达谱检测，平台为 GPL10558，物种为人（9606）
基本信息
资源简介
ALS患者人成纤维细胞与诱导多能干细胞的基因表达数据
Gene expression data from human fibroblasts and induced Pluripotent Stem cells from amyotrophic lateral sclerosis patients
该数据集来自 NCBI GEO（GSE64583），收录肌萎缩侧索硬化（ALS）患者来源的人成纤维细胞及经 Sendai 病毒介导重编程获得的诱导多能干细胞（hiPSc）的基因表达谱数据，采用芯片表达谱检测，平台为 GPL10558，物种为人（9606）。数据可用于比较成纤维细胞与 hiPSc 的转录组特征、评估重编程后细胞的多能性状态，并为 ALS 相关细胞模型研究提供表达谱参考（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 30 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们利用 Sendai 病毒介导的重编程因子递送，从肌萎缩侧索硬化（ALS，运动神经元病）患者生成了人诱导多能干细胞（hiPSc）。hiPSc 系已通过 SNP array 筛查以评估染色体稳定性（同时检测其来源的成纤维细胞系），并且在分化为运动神经元培养物及下游功能实验之前，通过 Pluritest 对转录组数据集的评估来提供 hiPSc 系多能性的验证。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL10558、9606。本站分类：神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE64583
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 13 201，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们利用仙台病毒介导的重编程因子递送，从肌萎缩侧索硬化症（ALS，运动神经元病）患者中产生了人诱导多能干细胞（hiPSc）。在分化为运动神经元培养物及下游功能测定之前，我们使用SNP阵列对hiPSc系进行了筛查，以评估染色体稳定性（连同其来源的成纤维细胞系），并通过Pluritest对转录组数据集的评估来验证hiPSc系的多能性。Mutihac R.、Scaber J.、Lalic T.、Ababneh N.、Vowles, J.、Fletcher-Jones A.、Douglas A.G.L.、Browne C.、Nakanishi M.、Turner M.、Wade-Martins R.、Cowley S.A. 和 Talbot K. 携带C9orf72扩增的ALS/FTD患者iPSC来源运动神经元中内质网钙稳态改变和应激颗粒形成。已投稿
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
