ALS患者人成纤维细胞与诱导多能干细胞的SNP数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE64582

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们利用仙台病毒介导的重编程因子递送，从肌萎缩侧索硬化症（ALS，运动神经元病）患者中产生了人诱导多能干细胞（hiPSc）。在分化为运动神经元培养物及下游功能测定之前，我们使用SNP阵列对hiPSc系进行了筛查，以评估染色体稳定性（连同其来源的成纤维细胞系），并通过Pluritest对转录组数据集的评估来验证hiPSc系的多能性。Mutihac R.、Scaber J.、Lalic T.、Ababneh N.、Vowles, J.、Fletcher-Jones A.、Douglas A.G.L.、Browne C.、Nakanishi M.、Turner M.、Wade-Martins R.、Cowley S.A. 和 Talbot K. 携带C9orf72扩增的ALS/FTD患者iPSC来源运动神经元中内质网钙稳态改变和应激颗粒形成。已投稿

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。