GSE6086:RNA结合蛋白Kep1缺失导致雄性果蝇胞质分裂缺陷与行为异常
该数据集来自 NCBI GEO(GSE6086),包含 1 个表达谱芯片系列矩阵文件,物种为果蝇(7227),平台为 GPL1467

基本信息
资源简介
GSE6086:RNA结合蛋白Kep1缺失导致雄性果蝇胞质分裂缺陷与行为异常
Loss of the RNA-binding protein Kep1 leads to cytokinesis defects and behavioural abnormalities in male Drosophila.
该数据集来自 NCBI GEO(GSE6086),包含 1 个表达谱芯片系列矩阵文件,物种为果蝇(7227),平台为 GPL1467。研究围绕 kep1 基因编码的含单个 maxi-KH 结构域 RNA 结合蛋白展开,发现雄性纯合 kep1- 果蝇几乎完全不育,伴随精子发生中约 10% 精子胞质分裂缺陷,且 Kep1 蛋白存在于成体脑神经元细胞核,纯合突变雄蝇求偶行为几乎消失。数据可用于分析 Kep1 缺失相关的基因表达变化及其与神经系统功能、生殖缺陷的关联(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 19 200。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):kep1 基因编码一种含有单个 maxi-KH 结构域的 RNA 结合蛋白。我们此前已证明,kep1 基因缺失会导致雌性果蝇生育力下降,并希望进一步表征雄性果蝇中的 kep1 突变。野生型雌性与纯合 kep1- 雄性交配后,所产卵中仅有 6% 孵化。这种繁殖成功率降低部分源于精子发生过程中的减数分裂缺陷,约 10% 的精子表现出胞质分裂缺陷。利用间接免疫组化,我们发现 Kep1 蛋白存在于成体脑神经元细胞的细胞核中,提示行为因素可能参与几乎完全的雄性不育表型。我们报告,纯合 kep1- 雄性几乎不表现求偶行为,测得的求偶指数中位数为 0.005,相对于 m
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1467、7227。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE6086
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 16 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE6086
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
kep1基因编码一种含有单一maxi-KH结构域的RNA结合蛋白。我们此前已证明,kep1基因缺失会导致果蝇雌性生育力下降,并希望进一步表征果蝇雄性中的kep1突变。野生型雌性与纯合kep1-雄性交配后,所产卵的孵化率为6%。这种繁殖成功率的降低部分归因于精子发生过程中的减数分裂缺陷,约10%的精子表现出胞质分裂缺陷。利用间接免疫组织化学方法,我们发现Kep1蛋白存在于成体脑神经元细胞的细胞核中,提示行为因素可能参与了几乎完全的雄性不育表型。我们报告,纯合kep1-雄性几乎不表现出求偶行为,其求偶指数中位数为0.005,而OreR野生型对照的中位数为0.77。为了更好地理解kep1的行为作用,我们开展了基因表达谱实验,以鉴定在kep1-纯合雄性中稳态水平发生改变的转录本。
我们的基因表达谱研究鉴定出61个转录本,其稳态水平在比较w1118与kep1-/kep1-雄性头部分离的RNA时发生至少2倍或以上的改变。在kep1-/kep1-头部中稳态表达水平降低的转录本中,很大一部分(44个中的10个)编码参与蛋白水解某些方面的蛋白质。我们的结果表明,Kep1蛋白在果蝇雄性中具有多效性作用,导致胞质分裂缺陷和行为异常。关键词:突变体与野生型比较
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




