成年听神经胶质细胞的神经干/祖细胞特性 [ouabain]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为成年听神经胶质细胞的神经干/祖细胞特性 [ouabain],采用表达谱芯片平台 GPL1261 对小鼠样本进行检测,仅含 1 个文件 GSE59416_series_matrix.txt.gz

geo
浏览 2
基因组分类Expression profiling by arrayGPL126110090
GSE59416: Neural Stem/Progenitor Cell Properties of Glial Cells in the Adult Auditory Nerve [ouabain]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

成年听神经胶质细胞的神经干/祖细胞特性 [ouabain]

Neural Stem/Progenitor Cell Properties of Glial Cells in the Adult Auditory Nerve [ouabain]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为成年听神经胶质细胞的神经干/祖细胞特性 [ouabain],采用表达谱芯片平台 GPL1261 对小鼠样本进行检测,仅含 1 个文件 GSE59416_series_matrix.txt.gz。研究以 ouabain 诱导的急性螺旋神经节神经元损伤小鼠模型为对象,考察成年听神经中是否存在神经干/祖细胞,并观察胶质细胞在神经元退化后的增殖与染色质状态变化。数据可用于分析听神经损伤后胶质细胞激活相关的基因表达改变(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 15 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):螺旋神经节神经元(SGNs)及相关听神经组分是听觉信息从毛细胞传向大脑的主要载体。SGNs 的丢失发生于多种病理状态,导致永久性感音神经性听力损失。神经干/祖细胞(NSPs)已在成年大脑和视网膜的若干区域得到充分表征。然而,成年听神经中是否存在 NSPs 尚不清楚。在此,我们利用 ouabain 处理作为成熟的急性 SGN 损伤小鼠模型,检测了成年听神经的自我更新潜能。观察到的细胞增殖增加、常染色质/异染色质比例改变以及胶质细胞中组蛋白去乙酰化酶表达下调,提示静息态胶质细胞在 SGN 退化后转变为激活状态。这一结论进一步通过全局基因 e 得到证实。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE59416

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 02 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE59416

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

螺旋神经节神经元(SGNs)及相关听神经组成部分是将听觉信息从毛细胞传递至大脑的主要载体。多种病理状态下均可发生SGNs丢失,导致永久性感音神经性听力损失。神经干细胞/祖细胞(NSPs)已在成年大脑和视网膜的多个区域得到充分表征。然而,成年听神经中是否存在NSPs尚不明确。本研究以哇巴因诱导作为成熟的急性SGN损伤小鼠模型,探讨了成年听神经的自我更新潜能。观察到的细胞增殖增加、常染色质/异染色质比例改变以及胶质细胞中组蛋白去乙酰化酶表达下调,提示静止态胶质细胞在SGN变性后转化为激活状态。损伤听神经的全基因表达分析进一步证实了这一点,显示哇巴因暴露后不久大量神经发生和/或发育相关基因上调,这些基因包括常用于鉴定NSPs的分子标志物。

在严格的培养条件下,成年小鼠耳蜗的听神经来源细胞形成了神经球,提示成年耳蜗神经中存在多能NSPs。对Sox2转基因小鼠进行的神经球实验表明,Sox2+胶质细胞是NSPs的来源。我们的数据还显示,急性损伤或低氧可增强神经球形成。综上所述,我们的研究揭示成年耳蜗的胶质细胞表现出若干NSP特征,因此这些成熟非神经元细胞可能是促进退行性听神经自我修复的重要靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。