大鼠脑死亡供体肾同种移植模型全基因组表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE5104

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自边缘供体或扩大标准供体的器官同种移植物的临床结果，无论在短期还是长期均不如活体供体移植的结果令人满意。术后早期移植物功能取决于若干移植前因素，其中主要的供体影响因素是脑死亡（BD）和缺血/再灌注（I/R）损伤。BD和I/R损伤的影响不仅减少功能性肾单位的数量，还触发宿主对移植肾的免疫应答。据推测，来自边缘来源的同种移植物在手术时可能并非生物学惰性，而是可能已被编程以启动或放大宿主反应。为排除同种异体抗原性的影响，我们建立了一个使用死亡供体的大鼠肾同系移植模型，并将结果与活体供体移植后获得的结果进行比较。在本研究中，我们使用移植手术前（0时点）和移植手术后1小时时间点获取的样本，对大鼠肾同系移植物中基因表达的变化进行了分析。

结果加深了我们对BD和/或I/R损伤所激活或下调的通路及级联反应的认识。更深入地了解BD或I/R损伤的关键组成部分，将为揭示触发导致器官活力下降的进展因素提供线索，并为如何克服此类移植物失败提供思路。这些数据还可能使我们能够识别新的生物标志物，作为不良结局的预测因子。关键词：疾病状态分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。