伴大头畸形的自闭症谱系障碍遗传图谱及KMT2E变异功能研究

该数据集来自 NCBI GEO,围绕伴大头畸形的自闭症谱系障碍(ASD-M)展开,通过全外显子测序结合 OMIM 整合识别风险基因,并对三个新型 KMT2E 突变在 HEK293T 和 SH-SY5Y 细胞中进行功能验证

geo
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基因组分类GPL342849606
GSE348157: Genetic landscape of Autism Spectrum Disorder with Macrocephaly and functional insights from KMT2E variants

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

伴大头畸形的自闭症谱系障碍遗传图谱及KMT2E变异功能研究

Genetic landscape of Autism Spectrum Disorder with Macrocephaly and functional insights from KMT2E variants

该数据集来自 NCBI GEO,围绕伴大头畸形的自闭症谱系障碍(ASD-M)展开,通过全外显子测序结合 OMIM 整合识别风险基因,并对三个新型 KMT2E 突变在 HEK293T 和 SH-SY5Y 细胞中进行功能验证。转录组分析覆盖两个独立样本集:一名 KMT2E 突变携带者与一名神经典型对照的外周血,以及野生型与 KMT2E 突变型 SH-SY5Y 细胞。数据可用于研究 ASD-M 的遗传基础及 O'Donnell-Luria-Rodan 综合征的潜在致病机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):自闭症谱系障碍(ASD)的异质性使病因学研究复杂化。头围作为脑发育的直接临床指标,有助于研究伴大头畸形的 ASD(ASD-M)的遗传病因。本研究旨在描绘 ASD-M 的遗传图谱,并就罕见 KMT2E 突变导致的 O'Donnell-Luria-Rodan 综合征的致病机制提出假设。在 ASD-M 儿童中进行的全外显子测序通过 OMIM 整合识别出风险基因。同时,在 HEK293T 和 SH-SY5Y 细胞中对三个新型 KMT2E 突变进行了功能验证。对两个独立样本集进行了转录组分析:一名 KMT2E 突变携带者与一名神经典型对照的外周血,以及野生型与 KMT2E 突变型 SH-SY5Y 细胞。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE348157

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 29 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自闭症谱系障碍(ASD)的异质性使病因学研究变得复杂。头围作为脑发育的直接临床指标,有助于研究伴巨头畸形的ASD(ASD-M)的遗传病因。本研究旨在描绘ASD-M的遗传图谱,并提出关于罕见KMT2E突变所致O’Donnell-Luria-Rodan综合征致病机制的假设。对ASD-M儿童进行的全外显子组测序通过整合OMIM识别出风险基因。同时,在HEK293T和SH-SY5Y细胞中对三种新的KMT2E突变进行了功能验证。对两个独立样本集进行了转录组学分析:一名KMT2E突变携带者与一名神经典型对照者的外周血,以及野生型与KMT2E突变型SH-SY5Y细胞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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