GSE336951：Smarcc1驱动视柄图式形成与视神经头星形胶质细胞分化

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336951

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数据说明

视神经由神经外胚层视柄发育而来，视柄经历协调的形态发生过程，产生支持视网膜神经节细胞（RGC）轴突的视神经星形胶质细胞。在本研究中，我们明确了星形胶质细胞从视柄形成的进程，并鉴定了SWI/SNF支架亚基Smarcc1（Baf155）和Smarcc2（Baf170）的阶段特异性功能。这两种因子在视网膜色素上皮（RPE）和视柄祖细胞中共表达，其中Smarcc2在分化的RPE和星形胶质细胞中持续表达。利用Dct-Cre进行条件性敲除显示色素谱系中存在代偿活性，而Smarcc1缺失则独特地破坏了视神经乳头（ONH）的形态发生，导致胶质层塌陷、RGC变性和进行性视力下降。空间转录组学和功能实验表明，Smarcc1通过抑制色素基因程序并允许Pax2/Sox2活性，使背侧视柄祖细胞从色素性RPE样状态转变为星形胶质细胞祖细胞。在特化之后，Smarcc1还是胶质层组装和星形胶质细胞迁移进入内视网膜所必需的。

这些发现表明，依赖Smarcc1的染色质重塑协调星形胶质细胞特化与视神经乳头（ONH）形态发生，从而维持长期视网膜功能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。