成年小鼠背根神经节培养中整合应激反应与ATF4的敲低和敲除

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336472

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

激活转录因子4（ATF4）在视神经轴突损伤后促进促再生的转录反应。本研究采用轴突再生的体外模型，探讨ATF4对成年小鼠背根神经节（DRG）感觉神经元转录损伤反应的贡献。我们发现，与视神经轴突损伤不同，促再生转录因子ATF3的上调并不依赖ATF4；在缺乏这一贡献的情况下，ATF4反而与C/EBPgamma协同限制成年DRG轴突的再生长。在该模型中，敲除或敲低ATF4可增强轴突再生，同时调控一组与C/EBPgamma所调控基因高度重叠的基因。我们发现，过表达ATF4以依赖C/EBPgamma的方式抑制轴突再生。然而，这一效应并非ATF4敲除的简单反向对应，因为它还与ATF3和c-Jun依赖性转录的抑制相关。综上，这些发现提示轴突损伤诱导了一个依赖ATF4的转录程序，该程序与促再生反应并行地限制再生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。