小鼠术后认知功能障碍海马小非编码RNA图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334921

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

术后认知功能障碍（POCD）常见于老年手术患者，并与记忆、注意力和执行功能的损害相关，可显著降低生活质量。POCD的确切发病机制尚不清楚，尽管创伤诱导的表观遗传机制已被认为参与其中。传统测序方法因修饰RNA处的逆转录停滞而受阻，这可能导致具有重要调控功能的小非编码RNA（sncRNA）代表性不足或丢失。在此，我们应用通过克服RNA修饰诱导的测序中止的全景RNA展示技术（PANDORA-seq），对经历手术诱导认知障碍小鼠海马中高度修饰的sncRNA进行了全面分析。该数据集描绘了术后早期对照组和手术暴露组小鼠海马sncRNA类别（包括miRNA、tsRNA、rsRNA和piRNA）的组成。我们进行了测序质量控制分析，并作为对选定测序信号的正交、检测水平验证，通过qRT-PCR对选定的tsRNA进行了定量。

还对这些tsRNA与其亲本tRNA的结构映射进行了分析。总体而言，这一资源为研究与早期术后认知障碍相关的神经表观遗传变化提供了基础，并为提出关于POCD分子机制的假设奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。