GSE334251:缰核时空重塑标志抑郁相关表型起始

源站描述显示,研究利用空间转录组学构建了小鼠 LHb 的空间分辨分子图谱,揭示在慢性皮质酮处理(小鼠抑郁模型)过程中基因表达呈现拓扑组织化且时间限定的重塑

geo
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基因组分类OtherGPL3447510090
GSE334251: Spatiotemporal remodeling in the habenula marks the onset of depression-related phenotypes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

GSE334251:缰核时空重塑标志抑郁相关表型起始

Spatiotemporal remodeling in the habenula marks the onset of depression-related phenotypes

该数据集来自 NCBI GEO(GSE334251),包含 1 个文件(GSE334251_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及 Other、GPL34475 与 10090。源站描述显示,研究利用空间转录组学构建了小鼠 LHb 的空间分辨分子图谱,揭示在慢性皮质酮处理(小鼠抑郁模型)过程中基因表达呈现拓扑组织化且时间限定的重塑。数据可用于探索 LHb 在抑郁相关表型起始阶段的时空分子变化,并为识别有效治疗时间窗提供基础资源(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 03 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性应激具有持久的不良后果,随时间推移可导致抑郁障碍,然而确定有效治疗的最佳时间窗仍是一项未满足的挑战。我们利用空间转录组学生成了 LHb 的空间分辨分子图谱,揭示了在整个慢性皮质酮处理(用作小鼠抑郁模型)过程中基因表达呈现拓扑组织化且时间限定的重塑。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL34475、10090。本站分类:精神与行为障碍。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE334251

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 07 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性应激具有持久的不良后果,随着时间推移可导致抑郁障碍,然而确定有效治疗的最佳时间窗仍是一项尚未解决的挑战。利用空间转录组学,我们构建了外侧缰核(LHb)的空间分辨分子图谱,揭示了在慢性皮质酮处理(用作小鼠抑郁模型)全程中基因表达呈现出拓扑组织化且具有时间特异性的重塑。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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