鞍区神经细胞瘤全基因组DNA甲基化分析数据集

资源简介

鞍区神经细胞瘤全基因组DNA甲基化分析数据集

GSE331022 是一个围绕鞍区神经细胞瘤（sellar neurocytoma，SELN）开展全基因组 DNA 甲基化分析的数据集，来源于 NCBI GEO 数据库。该数据集以基因组结合/占据谱分析（基于基因组 tiling 芯片）为主题，采用 GPL13534 平台，物种为人类（9606），共包含 1 个数据文件 GSE331022_series_matrix.txt.gz。数据集由 D. Pratt 提交，发布时间为 2025 年 5 月 14 日，本站将其归入神经系统疾病 / 其他分类。整体而言，该数据集为研究鞍区神经细胞瘤的表观遗传特征提供了甲基化层面的数据基础。

【数据集背景】

鞍区神经细胞瘤是发生于鞍区的一类神经系统肿瘤，其分子特征与表观遗传学改变是理解该疾病生物学行为的重要方面。DNA 甲基化作为关键的表观遗传修饰，在肿瘤发生发展、分型与鉴别诊断中具有重要价值。该数据集正是针对鞍区神经细胞瘤样本开展全基因组 DNA 甲基化分析，旨在从全基因组尺度刻画该类肿瘤的甲基化图谱，为相关基础研究与临床转化研究提供数据支撑。

【数据内容】

数据集的核心内容为鞍区神经细胞瘤样本的全基因组 DNA 甲基化谱数据。数据以 series matrix 文件形式组织，文件名为 GSE331022_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式，共 1 个文件。主题标签显示其属于基因组结合/占据谱分析（基于基因组 tiling 芯片）类型，平台编号为 GPL13534，物种为人类（9606）。源站描述明确指出，该数据集提供的是鞍区区域神经细胞瘤样本的全基因组 DNA 甲基化谱分析结果。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO 数据库（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Genome-wide DNA methylation analysis of sellar neurocytoma (SELN)”。数据由作者 D. Pratt 提交，发布时间为 2025 年 5 月 14 日。关于样本采集地点、采集时间、样本数量及具体临床信息等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于鞍区神经细胞瘤表观遗传特征的研究，可用于探索该肿瘤在全基因组范围内的 DNA 甲基化模式，支持肿瘤分子分型、表观遗传标志物挖掘以及与其它神经系统肿瘤的甲基化谱比较分析等研究方向。同时，基于芯片的甲基化谱数据也可作为方法学验证与生物信息学流程测试的输入数据。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE331022_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行解压与读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式，确认数据读取无误后再进行批量接入与后续分析。具体的分析流程与参数设置需结合研究目的确定，源站未提供针对该数据集的标准分析方案。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个 series matrix 文件，样本数量、分组信息、临床注释及质控指标等细节源站未提供。由于数据规模与注释信息的完整性有限，使用时需自行评估数据适用性。此外，基于芯片平台的甲基化数据在分辨率与定量精度上存在平台固有的局限，相关结论应结合其他类型数据加以验证。

【引用与许可】

该数据集的作者为 D. Pratt，来源为 NCBI GEO 数据库。关于数据的使用许可、引用格式及再分发条件，源站未提供，使用前应查阅源站页面获取最新说明。