人类腰段脊髓与运动皮层多组学图谱揭示ALS非重叠分子特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330130

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

肌萎缩侧索硬化（ALS）是一种致衰弱性神经退行性疾病，其特征分别为运动皮层（MTC）和脊髓（SC）中上、下运动神经元的丢失，导致肌肉萎缩并最终引发呼吸衰竭。尽管运动神经元（MNs）是选择性易受损的细胞类型，但其与胶质细胞的相互作用促进了ALS病理的进展。然而，目前尚不清楚ALS中MNs和胶质细胞功能障碍背后的分子改变在MTC和腰段脊髓（LSC）中是否相同。为解决这一问题，我们通过整合一组非神经系统对照者和按症状起病部位临床分层的ALS患者的空间及单核转录组图谱，构建了MTC和LSC的空间分辨基因表达图谱。在LSC腹角，我们观察到ALS患者中与MNs和突触信号传导相关的基因减少。我们还识别出内皮细胞和胶质细胞相关功能中的区域特异性改变。

值得注意的是，这些运动神经元缺陷及内皮相关功能的严重程度受症状起病部位的影响，而胶质细胞功能的改变则基本不受影响。在运动皮层（MTC）中，我们观察到ALS患者突触信号传导存在层特异性增强。比较ALS中LSC与MTC内的分子和细胞变化表明，二者主要呈非重叠状态，并具有不同的分子特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。