GSE325128：液泡ATP酶亚基Atp6v0c转基因促进损伤视网膜神经节神经元神经保护与长距离轴突再生

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325128

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

中枢神经系统（CNS）投射神经元无法修复/再生受损轴突，这对遭受CNS损伤的患者而言后果极为严重。因此，亟需能够促进CNS长距离轴突再生的可转化因子。我们假设，通过基因治疗补充损伤神经元中溶酶体的结构因子以支持溶酶体功能，可能促进轴突再生。为验证该假设，我们选择Atp6v0c进行实验性调控，因为该因子在损伤神经元中参与溶酶体酸化以及对内质网（ER）应激下错误折叠蛋白的降解。我们在啮齿类视神经夹伤（ONC）模型——一种创伤性视神经病变（TON）模型——中进行了测试，该模型中受损的典型CNS投射神经元即视网膜神经节细胞（RGCs）不能再生受损轴突并最终发生退变。Atp6v0c转基因表达通过玻璃体内注射的腺相关病毒血清型2（AAV2）实现，该病毒可转导RGCs。为进行基准比较，我们将疗效与AAV2靶向轴突再生的著名调控因子Pten和Klf9进行了对比。

我们发现，Atp6v0c转基因促进了RGC的存活和长距离轴突再生，其效果与靶向Pten和Klf9相当。因此，Atp6v0c是一种促进轴突再生的因子，具有治疗中枢神经系统损伤和疾病的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。