HSV-1感染后小鼠脑单细胞多组学图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE324144

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

1型单纯疱疹病毒（HSV-1）感染中枢神经系统会触发涉及微胶质细胞和浸润免疫细胞的局部先天免疫反应。为了表征与HSV-1感染相关的转录和染色质可及性变化，我们对经鼻内感染HSV-1或模拟处理后六天收集的小鼠脑组织进行了单细胞多组学（10x Chromium ATAC + 基因表达）分析。该数据集提供了数千个单细胞基因表达和染色质可及性的配对测量，使得能够对感染大脑中与抗病毒反应和微胶质细胞激活相关的调控程序进行整合分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。