二十碳五烯酸重编程脑血管代谢并损害脑损伤后修复：与慢性创伤性脑病相关 [小鼠脑RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319252

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

重复性轻度创伤性脑损伤（rmTBI）是慢性创伤性脑病（CTE）的前驱因素，并涉及神经血管功能障碍。Omega-3多不饱和脂肪酸（PUFA）被宣传具有神经保护作用，但脑损伤后的长期效应仍不确定。我们发现了一种与二十碳五烯酸（EPA）脑内蓄积相关的代谢脆弱性，EPA是一种主要来源于鱼油的PUFA。在鱼油饮食模型中，EPA在基线时蓄积，但在rmTBI后选择性耗竭，这与损伤相关代谢重塑过程中的动员相一致。该模式伴随基质重塑、内皮退化和神经血管功能受损。皮层转录组学显示血管生成程序减少而脂肪酸代谢增加，脂质组学将EPA与适应不良的脂质参与联系起来。使用代谢适应的内皮细胞进行的机制研究表明，EPA选择性损害修复功能。对死后CTE脑组织的分析揭示了平行的血管和代谢基因表达变化，增强了转化相关性。

这些发现共同挑战了脑损伤后omega-3具有统一神经保护作用的假设。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。