成年小鼠皮层TRP通道表达的长短读长转录组整合数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE315051

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

瞬时受体电位（TRP）离子通道是一类多模态阳离子通道，在外周感觉系统中的作用已得到充分确立，但其在成年大脑皮层中的表达图谱仍未被完全界定。本研究提供了来自成年小鼠大脑皮层的Oxford Nanopore直接RNA测序与Illumina RNA-seq整合数据集，以及作为外周感觉参考的背根神经节Illumina RNA-seq数据。两个平台均对三个独立的皮层生物学重复样本进行了分析。这些数据集可用于TRP通道基因及异构体水平表达的定量分析、转录本丰度的跨平台比较，以及基于长读长测序比对至Ensembl GRCm39第115版参考基因组的全长转录本表征。原始测序文件及处理后基因与转录本水平的表达表格作为资源提供，用于成年小鼠神经组织的转录组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。