PTSD患者海马免疫失衡的单核转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313257

标准获取流程：

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数据说明

创伤后应激障碍（PTSD）日益被认为是一种神经免疫疾病，其中神经元-胶质细胞相互作用的紊乱促成了长期的认知和情绪功能障碍。然而，人类海马中免疫失衡的细胞和分子基础仍不清楚。我们对PTSD供者和匹配对照者的死后海马组织进行了单核RNA测序，鉴定出10种主要细胞类型，并特别关注神经血管和胶质细胞群体。我们应用差异表达、通路富集、拟时序轨迹和细胞-细胞通讯分析来刻画细胞和分子改变。PTSD样本在星形胶质细胞、小胶质细胞、内皮细胞和壁细胞中均显示出应激反应和炎症信号通路的显著激活。小胶质细胞和星形胶质细胞经历了强烈的转录重编程，免疫相关通路富集，而内皮细胞和壁细胞则表现出炎症和血脑屏障稳态受损。轨迹分析揭示了星形胶质细胞和小胶质细胞状态转换的改变，表明对应激的反应失调。

此外，细胞间通讯分析揭示，星形胶质细胞或小胶质细胞与兴奋性神经元及少突胶质谱系细胞之间的相互作用显著减少，尤其涉及应激和炎症相关的配体-受体对。这些发现表明，PTSD的特征在于细胞和细胞间水平上的免疫失衡，其驱动因素是适应不良的胶质细胞激活以及神经元-胶质细胞通讯的破坏。我们的研究提供了PTSD中海马神经免疫景观的全面单细胞图谱，并强调功能失调的胶质细胞-神经元相互作用是疾病发病机制的核心机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。