GSE30960:dt27J小鼠背根神经节表型前表达分析

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE30960,针对dt27J小鼠表型出现前的背根神经节进行表达分析,采用表达谱芯片平台GPL7202,物种为小鼠(10090),仅含1个文件(GSE30960_series_matrix.txt.gz)

geo
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蛋白质分类Expression profiling by arrayGPL720210090
GSE30960: Expression analysis of pre-phenotype dt27J mouse dorsal root ganglia

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

GSE30960:dt27J小鼠背根神经节表型前表达分析

Expression analysis of pre-phenotype dt27J mouse dorsal root ganglia

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE30960,针对dt27J小鼠表型出现前的背根神经节进行表达分析,采用表达谱芯片平台GPL7202,物种为小鼠(10090),仅含1个文件(GSE30960_series_matrix.txt.gz)。源站描述聚焦dystonin-a2亚型在微管稳定性、高尔基体组织及分泌途径中的作用机制。数据可用于研究感觉性共济失调相关神经退行性变的早期转录变化,并支持基于表达谱的样本分类分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 26 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):dystonin细胞骨架连接蛋白的功能缺失会导致感觉性共济失调、肌张力障碍小鼠(dt)的神经退行性变。尽管大量研究集中于理解dt病理学,dystonin亚型的分歧功能仍不清楚。在此,我们强调dystonin-a2亚型在介导微管(MT)稳定性、高尔基体组织和分泌途径通量中的新功能。利用dystonin缺失小鼠结合亚型特异性功能缺失分析,我们发现dystonin-a2在中心体周围区域与MAP1B结合,并在该处维持MT乙酰化。在dt中,MAP1B-dystonin-A2相互作用的缺失导致MAP1B核周定位丧失,进而引起MT脱乙酰化和不稳定。脱乙酰化的MT导致高尔基体碎片化并阻止马达蛋白的顺行运输。维持MT乙酰化

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL7202、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30960

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 12 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30960

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肌张力障碍性肌营养不良蛋白(dystonin)细胞骨架连接蛋白的功能缺失会导致感觉性共济失调——肌张力障碍性肌营养不良(dystonia musculorum,dt)中的神经退行性变。尽管大量研究集中于理解dt的病理机制,但dystonin不同亚型的分化功能仍不清楚。在此,我们揭示了dystonin-a2亚型在介导微管(MT)稳定性、高尔基体组织及分泌途径通量方面的新功能。利用dystonin缺失小鼠结合亚型特异性功能缺失分析,我们发现dystonin-a2在中心体周围区域与MAP1B结合,并在该处维持MT乙酰化。在dt中,MAP1B-dystonin-A2相互作用的缺失导致MAP1B核周定位丧失,进而引起MT脱乙酰化和不稳定。脱乙酰化的MT导致高尔基体碎裂并阻碍马达蛋白的顺行运输。通过TSA给药或体外MAP1B过表达来维持MT乙酰化,可减轻所观察到的缺陷。这些异常在表型出现前的背根神经节(DRG)和原代感觉神经元中已明显可见,提示它们是dt疾病的致病原因。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。