偏头痛感觉神经元中SETDB2/KLF4/IDE/CGRP信号轴研究数据集[SETDB2-up]

研究聚焦三叉神经节神经元中SETDB2在偏头痛相关疼痛行为中的作用,涉及硝酸甘油诱导的慢性头痛模型及H3K9me3修饰变化,可用于偏头痛分子机制与差异表达分析(来源 NCBI)

geo
浏览 17
时间序列分类GPL2424710090
GSE308024: The SETDB2/KLF4/IDE/CGRP signaling axis in sensory neurons involved in migraine [SETDB2-up]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

偏头痛感觉神经元中SETDB2/KLF4/IDE/CGRP信号轴研究数据集[SETDB2-up]

The SETDB2/KLF4/IDE/CGRP signaling axis in sensory neurons involved in migraine [SETDB2-up]

该数据集来自NCBI GEO,标题为SETDB2/KLF4/IDE/CGRP信号轴在偏头痛感觉神经元中的作用[SETDB2-up],包含1个文件GSE308024_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。研究聚焦三叉神经节神经元中SETDB2在偏头痛相关疼痛行为中的作用,涉及硝酸甘油诱导的慢性头痛模型及H3K9me3修饰变化,可用于偏头痛分子机制与差异表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性偏头痛特有的持续性头痛可能源于三叉血管通路中初级传入神经元的激活和敏化。然而,这种病理生理学的分子基础仍不完全清楚。在本研究中,我们证明SETDB2——一种在三叉神经节(TG)神经元中表达的组蛋白甲基转移酶——在促进偏头痛相关疼痛行为中发挥关键作用。我们通过反复给予硝酸甘油(NTG,一种在偏头痛患者中公认的偏头痛触发因素)来模拟慢性头痛,并观察到NTG处理后小鼠TG神经元中SETDB2显著上调。在偏头痛患者的脑脊液中也发现了类似的增加。逆转NTG诱导的SETDB2上调消除了组蛋白H3K9三甲基化(H3K9me3)的增加并缓解了已建立的

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308024

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 28 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308024

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性偏头痛所特有的持续性头痛可能源于三叉神经血管通路内初级传入神经元的激活和敏化。然而,该病理生理过程的分子基础仍未完全阐明。在本研究中,我们证明SETDB2——一种在三叉神经节(TG)神经元中表达的组蛋白甲基转移酶——在促进偏头痛相关疼痛行为中发挥关键作用。我们通过反复给予硝酸甘油(NTG,一种公认的偏头痛诱发剂)建立慢性头痛模型,观察到NTG处理后小鼠TG神经元中SETDB2显著上调。在偏头痛患者的脑脊液中也发现了类似的升高。逆转NTG诱导的SETDB2上调可消除组蛋白H3K9三甲基化(H3K9me3)的增加,并缓解已形成的偏头痛相关疼痛行为。相反,在完整TG神经元中模拟SETDB2的上调足以诱导痛觉过敏。

此外,我们发现NTG诱导的SETDB2上调阻止了转录因子KLF4与胰岛素降解酶(Ide)基因启动子的结合。这反过来抑制了IDE的表达,并阻碍了降钙素基因相关肽(CGRP)在TG神经元中的降解,而CGRP是预防偏头痛的一个有前景的靶点。靶向感觉性SETDB2-KLF4-IDE转录轴可能为治疗偏头痛提供新的治疗机会。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。