HIV-1 Tat蛋白暴露对小鼠皮层及人脑微血管内皮细胞形态与基因表达的影响

该数据集来自 NCBI GEO(GSE307481),聚焦 HIV-1 Tat 蛋白暴露对原代小鼠皮层内皮细胞和人脑微血管内皮细胞(HBMVECs)形态特征与基因表达的影响

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基因组预测GPL185739606
GSE307481: HIV-1 Tat protein exposure alters the morphological characteristics and gene expression in the primary mouse cortex endothelial cells and human brain microvascular endothelial cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-29

资源简介

HIV-1 Tat蛋白暴露对小鼠皮层及人脑微血管内皮细胞形态与基因表达的影响

HIV-1 Tat protein exposure alters the morphological characteristics and gene expression in the primary mouse cortex endothelial cells and human brain microvascular endothelial cells

该数据集来自 NCBI GEO(GSE307481),聚焦 HIV-1 Tat 蛋白暴露对原代小鼠皮层内皮细胞和人脑微血管内皮细胞(HBMVECs)形态特征与基因表达的影响。源站描述显示,Tat 暴露的 HBMVECs 出现 CD31 表达降低、phalloidin 染色强度升高,RNA-seq 分析揭示炎症反应通路激活。数据含 1 个文件(GSE307481_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱,可用于研究血脑屏障损伤机制及 HAND 相关内皮细胞变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 09 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在联合抗逆转录病毒治疗时代,HIV-1相关神经认知障碍(HAND)高度流行。近期研究表明,血脑屏障(BBB)损伤可能作为HIV感染者认知功能障碍的早期生物标志物。在本研究中,我们聚焦于内皮细胞——BBB的核心组分,探究HIV-1转录激活因子(Tat)蛋白对其形态学改变和人脑微血管内皮细胞(HBMVECs)基因表达谱的影响。我们的结果表明,暴露于Tat的HBMVECs显示CD31表达降低、phalloidin染色强度增加,并且RNA-seq分析揭示炎症反应通路激活。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307481

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 21 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在联合抗逆转录病毒治疗时代,HIV-1相关神经认知障碍(HAND)的患病率很高。近期研究表明,血脑屏障(BBB)的损伤可能作为HIV感染者认知功能障碍的早期生物标志物。本研究聚焦于BBB的核心组分——内皮细胞,探讨HIV-1转录激活因子(Tat)蛋白对人脑微血管内皮细胞(HBMVECs)形态学改变及其基因表达谱的影响。我们的结果表明,暴露于Tat的HBMVECs表现为CD31表达降低、鬼笔环肽染色强度增加,且RNA-seq分析显示炎症反应通路被激活。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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