单细胞转录组揭示益生菌逆转新生期吗啡诱导的基因破坏及青少年痛觉过敏

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298919

标准获取流程：

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数据说明

新生儿重症监护病房（NICU）常使用吗啡来管理疼痛。然而，其对疼痛通路神经发育的长期影响仍是一个重要关切。中脑是疼痛加工和阿片类药物介导镇痛中发挥核心作用的关键区域。在此，我们对107,427个来自青少年小鼠中脑的单细胞进行了单细胞RNA测序，以研究其基因表达，这些小鼠在新生儿期分别暴露于生理盐水、吗啡或吗啡联合益生菌婴儿双歧杆菌（B. infantis）。我们发现在神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞中转录组存在广泛改变。对差异调控基因的分析显示，在新生儿期接受吗啡治疗的青少年中，HOX基因下调，而与神经递质信号和疼痛相关的通路上调。有趣的是，新生儿期补充益生菌减轻了这些吗啡诱导的转录组改变。本研究提供了首个新生儿期吗啡暴露及益生菌干预后青少年中脑的单细胞RNA测序数据集。

这些发现为早期阿片类药物暴露对神经发育的影响提供了新的见解，并突显了针对微生物组的干预措施的治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。