狼疮性肾炎血清诱导人肾小球内皮细胞基因表达变化及L-sepiapterin调控

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296560

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

狼疮性肾炎（LN）的特征是肾内皮功能障碍，进而导致进行性肾损伤。内皮型一氧化氮合酶（eNOS）在LN中发挥调节作用，因为eNOS酶基因敲除会加重疾病。活动性LN患者的血清可诱导eNOS同源二聚体解偶联，导致eNOS产生超氧化物（SO）而非一氧化氮（NO）。L-墨蝶呤（L-Sep）可逆转这种解偶联。本研究旨在进一步探讨LN血清诱导的肾小球内皮细胞基因表达变化，以及L-Sep治疗能否改善这些变化。方法：将原代人肾小球内皮细胞（HRGECs）与非狼疮对照（HC）血清、LN缓解期患者（LN rem）血清或LN活动期患者（LN flare）血清共同培养，并分别在有或无L-Sep的条件下处理。对培养细胞提取的RNA进行bulk RNA测序。确定差异基因表达，并对差异表达基因进行通路和基因富集分析。结果：在LN活动期血清培养的HRGECs中，L-Sep处理可诱导差异基因表达。

添加L-Sep诱导的基因参与促进内皮功能，并富集于NO生物合成与代谢过程、脂肪酸和脂质生物合成、神经递质生物合成、活性氧生物合成、血管内皮生长因子产生以及平滑肌收缩调节等通路。结论这些结果表明，在LN血清环境中，肾小球内皮细胞能够启动活跃的炎症反应。更重要的是，L-Sep调节基因表达的方式与减少氧化应激和增加NO产生相一致。这些发现为靶向内皮功能障碍以L-Sep作为治疗手段调节LN提供了理论依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。