GSE296324：PROX1调控小鼠Corti器细胞模式、神经支配与分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296324

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Corti器被划分为负责听觉或耳蜗放大的功能分区。内侧分区包含由I型螺旋神经节神经元支配的内毛细胞，外侧分区包含由II型螺旋神经节神经元支配的外毛细胞。支持细胞也有所不同，外侧分区的柱细胞和Deiters细胞发育出特化的细胞结构以支持外毛细胞的电运动。我们培育了Corti器限制性Prox1条件性敲除小鼠以研究外侧分区发育，因为PROX1是首个严格表达于外侧分区支持细胞的转录因子。在缺乏Prox1的情况下，支持细胞数量增加而外毛细胞无相应变化，且基于形态学标准它们似乎分化不完全。外毛细胞数量未受影响，但神经支配被破坏，许多传入神经元错误地转向耳蜗顶回。RNAseq未揭示可解释该神经支配表型的基因表达变化。

因此，我们提出PROX1促进柱细胞和Deiters细胞的分化与组织，这对神经支配具有次要影响，但并非区域特化所必需。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。