TEAD沿神经祖细胞谱系进程切换互作伙伴以执行不同功能

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285025

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TEAD转录因子家族最为人所知的是作为Hippo通路中的DNA结合因子，在该通路中这些因子通过与转录共激活因子YAP和TAZ（YAP/TAZ）相互作用而发挥作用。尽管Hippo通路十分重要，但TEAD在哺乳动物体内的功能尚未得到充分确立。通过比较缺乏TEAD1和TEAD2（TEAD1/2）的小鼠突变体与缺乏YAP/TAZ的小鼠突变体，我们发现TEAD1/2在腹侧端脑发育过程中同时具有依赖YAP/TAZ和不依赖YAP/TAZ的功能。TEAD1/2缺失与YAP/TAZ缺失同样会破坏神经上皮顶端连接。然而，二者缺失对祖细胞谱系进程的影响基本相反：YAP/TAZ缺失耗竭早期祖细胞并增加晚期祖细胞，这与其促进祖细胞自我更新和增殖的已知功能一致；而TEAD1/2缺失则扩增早期祖细胞并减少晚期祖细胞，表明TEAD1/2促进谱系进程。我们进一步表明，TEAD1/2至少部分通过抑制Notch信号传导并与胰岛素瘤相关蛋白1（INSM1）协同作用来促进神经祖细胞谱系进程。

TEAD和INSM1的直系同源物已被证明在蠕虫和果蝇中协同调控神经细胞命运决定。我们的研究揭示了这一转录因子复合物在后生动物神经发育过程中功能具有显著的进化保守性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。