DYT6肌张力障碍致病蛋白THAP1通过PSMB5转录调控负责蛋白酶体活性

该数据集来自NCBI GEO,标题为DYT6肌张力障碍致病蛋白THAP1通过PSMB5转录调控负责蛋白酶体活性。研究通过全基因组遗传筛选鉴定THAP1为蛋白酶体活性调控因子,并证明其直接调控PSMB5表达

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基因组预测GPL3017210090
GSE283266: The DYT6 dystonia causative protein THAP1 is responsible for proteasome activity via PSMB5 transcriptional regulation

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

DYT6肌张力障碍致病蛋白THAP1通过PSMB5转录调控负责蛋白酶体活性

The DYT6 dystonia causative protein THAP1 is responsible for proteasome activity via PSMB5 transcriptional regulation

该数据集来自NCBI GEO,标题为DYT6肌张力障碍致病蛋白THAP1通过PSMB5转录调控负责蛋白酶体活性。数据包含1个文件GSE283266_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台GPL30172。研究通过全基因组遗传筛选鉴定THAP1为蛋白酶体活性调控因子,并证明其直接调控PSMB5表达。该数据可用于探索THAP1-PSMB5轴在蛋白酶体基础表达调控及DYT6肌张力障碍发病机制中的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):蛋白酶体在蛋白质降解中起关键作用,其功能受损与多种病理状况相关,包括神经退行性疾病。众所周知,Nrf1协调所有蛋白酶体基因的诱导以响应蛋白酶体功能障碍。然而,调控蛋白酶体基础表达的分子机制仍不清楚。在此,我们通过全基因组遗传筛选鉴定出转录因子THAP1——DYT6肌张力障碍的致病基因——作为蛋白酶体活性的调控因子。我们证明THAP1直接调控PSMB5基因的表达,该基因编码核心蛋白酶亚基β5。THAP1的缺失破坏了蛋白酶体组装,导致蛋白酶体活性降低和泛素化蛋白积累。这些发现揭示了蛋白酶体的一种新的调控机制,并提示一个p

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30172、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE283266

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 18 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

蛋白酶体在蛋白质降解中发挥关键作用,其功能受损与多种病理状态相关,包括神经退行性疾病。众所周知,Nrf1协调所有蛋白酶体基因的诱导以应对蛋白酶体功能障碍。然而,调控蛋白酶体基础表达的分子机制仍不清楚。本研究通过全基因组遗传筛选,鉴定出转录因子THAP1——DYT6型肌张力障碍的致病基因——为蛋白酶体活性的调控因子。我们证明THAP1直接调控PSMB5基因的表达,该基因编码核心蛋白酶亚基β5。THAP1的缺失破坏了蛋白酶体组装,导致蛋白酶体活性降低和泛素化蛋白积累。这些发现揭示了蛋白酶体的一种新的调控机制,并提示蛋白酶体功能障碍在肌张力障碍发病机制中的潜在作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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