多胺代谢失调导致ALS肌纤维易损性的空间转录组数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281403

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种致死性神经退行性疾病，其特征是由于运动神经元的原发性和继发性变性而导致进行性瘫痪。尽管已开展了大量生物医学研究，目前仍未建立治愈性疗法。ALS的主要靶标之一是骨骼肌，随着疾病进展，骨骼肌会发生深刻的功能改变。为更好地理解疾病进展过程中神经支配的改变如何干扰肌肉稳态，我们在ALS的SOD1G93A小鼠模型中生成了首个骨骼肌空间转录组数据集。利用该策略，我们确定多胺（PA）代谢是受累肌纤维中发生改变的主要通路之一。通过建立肌纤维易损性与该代谢通路失调之间的相关性，我们证明破坏多胺稳态会导致与ALS肌肉中所见相似的损伤。最后，我们证明恢复多胺稳态可挽救SOD1G93A小鼠的肌肉表型，为ALS的治疗开辟了新前景。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。