正常与NeuroD1过表达小胶质细胞在正常及TBI条件下的scRNA-seq数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277222

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

直接将胶质细胞转化为神经元为治疗损伤和神经退行性疾病提供了一种有前景的再生策略。多项研究表明，NeuroD1能够在不经过中间阶段的情况下将星形胶质细胞和小胶质细胞转化为神经元。为了确证NeuroD1是否能够将小胶质细胞转化为神经元，我们采用LSLNeuroD1-GFP和Cx3cr1-creER小鼠进行遗传谱系追踪，以在小胶质细胞中特异性诱导NeuroD1表达。我们进一步进行了单细胞RNA测序（scRNA-seq）以追踪经NeuroD1处理的细胞的命运。我们的研究结果显示，表达异位NeuroD1的细胞是真正的小胶质细胞，而非神经元，且与损伤预处理无关。此外，小胶质细胞中NeuroD1的过表达并不能促进脑损伤恢复，且小胶质细胞的身份保持完整。这些结果提供了确凿的证据，表明NeuroD1无法将小胶质细胞转化为神经元。我们的研究强调了谱系追踪和细胞命运定位策略在验证胶质细胞向神经元转化中的必要性，凸显了在再生研究中严格验证的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。