GSE271293：稳态与病毒性脑炎条件下小胶质细胞真实分子特征转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271293

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数据说明

小胶质细胞在抵御嗜神经病毒感染中发挥一线防御作用，然而，确定其在健康与疾病状态下真实的转录谱仍具有挑战性。本研究结合多种实验工具，描绘了病毒感染期间小胶质细胞的整体转录景观。通过利用核糖体标记方法，我们建立了通过比较免疫沉淀RNA与总RNA来富集相关标记基因的概念。与靶细胞中表达基因相对应的富集转录本有助于界定小胶质细胞的真实特征性签名。借助该方法，我们生成了健康及病毒感染条件下原位环境中全面且准确的小胶质细胞转录组。这些统一的小胶质细胞签名可作为基准，用于回溯性评估现有图谱中的离体伪影。利用小胶质细胞翻译组，我们发现VSV感染过程中与T细胞活化和细胞因子产生相关的基因出现富集。

这些数据将小胶质细胞与T细胞再刺激联系起来，并进一步强调小胶质细胞塑造大脑中的抗病毒T细胞反应。总体而言，本研究忠实描绘了稳态及病毒性脑炎期间小胶质细胞的转录图谱，并突出了小胶质细胞与T细胞之间有助于控制病毒播散的细胞相互作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。