多胺失调导致ALS肌纤维易损性空间转录组数据集

该数据集为SOD1G93A ALS小鼠模型骨骼肌的首个空间转录组数据,包含1个文件(GSE271011_series_matrix.txt.gz),用于研究ALS病程中肌纤维易损性的分子机制

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基因组分类OtherGPL2424710090
GSE271011: Polyamine Dysregulation Contributes to Muscle Fibers Vulnerability in ALS

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

多胺失调导致ALS肌纤维易损性空间转录组数据集

Polyamine Dysregulation Contributes to Muscle Fibers Vulnerability in ALS

该数据集为SOD1G93A ALS小鼠模型骨骼肌的首个空间转录组数据,包含1个文件(GSE271011_series_matrix.txt.gz),用于研究ALS病程中肌纤维易损性的分子机制。数据覆盖骨骼肌空间转录组表达谱,可支持多胺代谢通路分析、肌纤维亚群分类及疾病进展相关基因表达模式探索(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肌萎缩侧索硬化(ALS)是一种致命的神经退行性疾病,其特征是由于运动神经元的原发性和继发性变性而导致的进行性瘫痪。尽管生物医学研究付出了巨大努力,但该疾病尚未建立治愈性疗法。鉴于骨骼肌通过神经肌肉接头(NMJ)稳定化与神经元直接相互作用,骨骼肌似乎是ALS的主要靶标,导致其功能发生深刻改变。在此,我们生成了SOD1G93A骨骼肌作为ALS小鼠模型的第一个空间转录组数据集。利用该策略,我们将多胺(PA)代谢鉴定为受影响肌纤维中的主要改变通路之一。通过将PA平衡鉴定为疾病进展过程中纤维易损性的关键因素,我们表明肌肉中PA平衡的扰动类似于观察到的疾病特征

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271011

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 21 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肌萎缩侧索硬化症(ALS)是一种致死性神经退行性疾病,其特征是由于运动神经元的原发性和继发性变性而导致进行性瘫痪。尽管生物医学研究付出了巨大努力,但迄今尚未建立针对该疾病的治愈性疗法。鉴于骨骼肌通过神经肌肉接头(NMJ)稳定化与神经元直接相互作用,骨骼肌似乎是ALS的主要靶标,其功能发生深刻改变。在此,我们生成了作为ALS小鼠模型的SOD1G93A骨骼肌的首个空间转录组学数据集。利用这一策略,我们确定多胺(PA)代谢是受累肌纤维中发生改变的主要通路之一。通过确定PA平衡是疾病进展过程中纤维易感性的关键因素,我们表明肌肉中PA平衡的扰动类似于在ALS受累肌肉中观察到的疾病特征。最后,我们表明恢复PA通量可挽救SOD1G93A小鼠的肌肉表型,为ALS的治疗开辟了新前景。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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